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La culture académique du ‘publish or perish’ pourrait avoir indirectement propagé le déluge des journaux prédateurs (suite et pas encore fin)

Par : Herve Maisonneuve
La partie émergée d’un iceberg : nous pouvons tous nous faire piéger Les journaux prédateurs seraient en difficulté si nos collègues académiques de tous pays avaient été vigilants et avaient propagé les bonnes pratiques de publication. Un court article du BMJ en mars 2024 nous rappelle les précautions élémentaires en apportant des témoignages. Son titre […]
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La culture académique du ‘publish or perish’ pourrait avoir indirectement propagé le déluge des journaux prédateurs

Par : Herve Maisonneuve
Le titre de ce billet est un des messages d’un excellent article investiguant le comportement des chercheurs faisant des synthèses de la littérature vis-à-vis des journaux prédateurs. Cet article publié fin 2023 dans une revue Wiley ‘Research Synthesis Methods’ a pour titre « Predatory journals and their practices present a conendrum for systematic reviewers and evidence […]
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Pour les mystiques, fanas et fadas qui adorent MDPI… un numéro spécial sur Dieu et la spiritualité

Par : Herve Maisonneuve
Je suis respectueux des religions mais quand on me sollicite pour payer probablement pour recycler des trucs qui seront acceptés avec un peer reveiw probablement sous-traité à une intelligence artificielle, cela me chatouille.
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Rencontres de l’esprit critique.. Les REC de Toulouse fin avril sont un évènement grand public

Par : Herve Maisonneuve
Les places seront vite épuisées…  car c’est gratuit et le panel des intervenants est impressionnant. Les REC 2024 se déroulent le samedi 27 et le dimanche 28 avril 2024. Inscrivez-vous sur REC et profitez d’un week-end à Toulouse. Avant tout, félicitons le maître d’oeuvre, Willy Lafran… impressionnant car l’équipe est réduite. Un programme dense avec […]
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Citations des articles retirés de la littérature dans le domaine microRNA : des chinois essentiellement

Par : Herve Maisonneuve
Le JAMA Network Open, en mars 2024, a publié une revue systématique sur la citation des articles retirés de la littérature Un domaine problématique pour les rétractations : microRNA Parmi les rétractations en génétique, il semble que le domaine microRNA représente 50 à 60 % des rétractations. Des études ont montré que les articles retirés […]
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Cas IS n° 13 : Comment choisir un laboratoire pour ma thèse de doctorat, PhD ?

Par : Herve Maisonneuve
Dans quel labo faire ma thèse ? Depuis trois mois, je suis dans un labo et je dois choisir d’ici un mois où je ferais ma thèse pour un doctorat (PhD pour Philosophiæ doctor). Dans le laboratoire où je suis, le directeur est pressé et il y a beaucoup de pression. Il publie beaucoup d’articles […]
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Les pratiques d’ajouter des auteurs honoraires sont très fréquentes dans les sciences de la santé

Par : Herve Maisonneuve
Des études incluses de mauvaise qualité C’est une revue systématique avec méta-analyse d’enquêtes sur la pratique dite des auteurs honoraires. Ce sont ces collègues ajoutés dans la liste des auteurs par complaisance. En général, ils n’ont rien fait et penseront qu’il faut renvoyer l’ascenseur. C’est une stratégie gagnant-gagnant voire plutôt perdant-perdant. Cet article de 15 […]
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Les origines des rédacteurs américains sont diverses au sein des 13 revues du groupe JAMA

Par : Herve Maisonneuve
Nous sommes dans ces mouvements DEI (Diversity, Equity, Inclusion) en Amérique du nord, et dans de nombreux autres Pays. La Société royale de chimie (UK) a fédéré les actions au sein du Joint Commitment for Action on inclusion and diversity in publishing. C’est un réseau de 56 éditeurs qui regroupe environ 15 000 revues. Les […]
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COVID-19 : les préprints d’essais cliniques publiés ultérieurement dans des revues à comité de lecture sont un peu améliorés par le peer-review

Par : Herve Maisonneuve
BMC Methodological Research Methodology a publié début 2024 un bon article de nos collègues du centre d’épidémiologie clinique de l’Hôtel-Dieu, Paris. L’objectif a été de comparer des preprints aux articles ensuite publiés dans des revues. Ce sont des préprints d’essais contrôlés randomisés (ECR) qui ont été étudiés. Méthodes bien décrites,… je passe. J’ai regardé les […]
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Cas IS n° 12 : Choisir un test statistique qui donne un résultat significatif

Par : Herve Maisonneuve
Après les conflits d’auteurs, les citations inappropriées, les problèmes de stat sont fréquents Je commence l’analyse de mes données. J’ai utilisé des méthodes statistiques, essentiellement des tests prévus au départ dans le protocole La signification statistique est peu satisfaisante : les résultats sont non significatifs ou très peu significatifs donc je n’arriverai probablement pas à […]
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IA : recommandations de l’Académie nationale de médecine

Par : Herve Maisonneuve
Un rapport sur les systèmes d’IA générative en santé vient d’être mis en ligne après avoir été largement accepté par l’Académie. Il y a trois auteurs dont un chirurgien (Nordlinger) en premier auteur. Le rapport ne dit pas grand chose sur IA et publications. C’est un très large panorama sur l’arrivée de l’IA et c’est […]
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L’année 2023 du JAMA : comment évaluer les 275 manuscrits reçus chaque semaine ?

Par : Herve Maisonneuve
Avec un facteur d’impact de 120, le JAMA, comme les V5 (Annals, BMJ, JAMA, Lancet, NEJM), publie en général des articles de qualité. Comme tous les journaux du groupe JAMA, chaque année sont publiées les données de l’année précédente (article du 8 mars 2024). Je vous laisse voir une partie des informations dans l’image ci-dessous. […]
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Grandeurs et décadences des études de médecine : bravo à Céline Pulcini

Par : Herve Maisonneuve
Ce livre est un roman écrit par l’une de nos collègues, et il se lit facilement, avec envie de poursuivre d’un chapitre à l’autre. Les chapitres sont courts, ce qui est agréable. Vite lu car il est passionnant et il présente très bien le parcours de 12 ans d’une héroïne, Manon, qui fait ses études […]
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Liquidation de l’IHU Méditerranée infection : une étape indispensable pour repartir mais quand ?

Par : Herve Maisonneuve
Nous allons fêter les 4 ans de pandémies, et surtout les 4 ans de dérives du druide des calanques sans qu’il ait été menacé. Il va bien, continue ses activités complotistes, sauf que son audience baisse lentement. C’est l’heure des comptes nous dit la prestigieuse revue Science Cet article de 5 pages du 7 mars […]
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Cas IS n° 11 : Faire une mauvaise revue systématique ou risquer de ne pas avoir sa thèse d’exercice

Par : Herve Maisonneuve
Les thèses d’exercice en médecine sont un étonnement sans fin. Je côtoie beaucoup d’internes en médecine ayant besoin d’aides pour écrire leurs thèses. Je ne fais jamais de commentaires sur les connaissances méthodologiques des directeurs de thèses… NO COMMENT. Voici un cas rencontré plusieurs fois : Que penser du tandem directeur de thèse / interne ? J’ai […]
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Formation des IPA (Infirmiers en Pratiques Avancées) à la rédaction scientifique

Par : Herve Maisonneuve
Améliorer l’accès aux soins en diversifiant l’activité des soignants peut se faire par le développement des infirmiers en pratique avancée (IPA). Nous avons vu avant-hier que les IPA publiaient, avec un exemple de publication dans une revue de rang A. Hier, nous avons vu que l’arrivée de nouveaux acteurs qui seraient auteurs d’articles posaient quelques […]
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La formation des IPA (Infirmiers de pratique avancée) comprend l’apprentissage à la recherche

Par : Herve Maisonneuve
Nous avons vu hier la JIRSI 2023 qui s’adresse aux professionnels paramédicaux ayant des activités de recherche clinique. Parmi eux, il y a les IPA (Infirmiers de pratique avancée), profession qui doit trouver sa place dans les organisations de soins. Il y a 1600 IPA en France, et s’intégrer dans un système oblige de se […]
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La JIRSI 2023 du GIRCI IDF : quelques explications sur ces initiatives très intéressantes

Par : Herve Maisonneuve
J’ai eu l’honneur d’être invité lors de la journée du 28 novembre 2023 du GIRCI IDF. Il y a sept groupements interrégionaux pour la recherche clinique et l’innovation (GIRCI) en France. Le GIRCI IDF (Ile de France) fédère et anime un collectif de plus de 30 établissements de santé et représentants de professionnels de santé […]
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Quel avenir pour le score SIGAPS : l’Ofis nous invite à en débattre… Que vont devenir les crédits alloués à 100 articles retirés de la littérature ?

Par : Herve Maisonneuve
Un beau programme à découvrir C’est le mercredi 20 mars 2024 que nous sommes invités par l’Ofis pour discuter des Enjeux pour l’évaluation et le financement de la recherche biomédicale en France. Il faut s’inscrire sur le site Ofis. Gratuit, merci. Question importante au sein des établissements de santé qui ont besoin de ressources pour […]
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Les revues de faible qualité prospèrent avec des rédacteurs complaisants, mais certains démissionnent

Par : Herve Maisonneuve
C’est un tweet de Retraction Watch (RW) le 25 février 2024 qui nous informe sur la démission en mai 2023 de 31 rédacteurs de la revue Frontiers in Sustainability. Il arrive que des comités de rédaction, des rédacteurs soient en conflit avec l’éditeur. Sur Retraction Watch, il y a une liste de 29 cas de […]
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Enquête auprès d’étudiants et jeunes chercheurs sur leurs pratiques de l’intelligence artificielle pour leur formation

Par : Herve Maisonneuve
Je n’ai pas pour habitude de relayer des demandes d’enquêtes, mais celle ci me paraît originale et utile pour comparer la France aux autres pays dans le domaine de l’IA (Intelligence Artificielle). Elle provient de la meilleure équipe de journalologie au Canada, dirigée par David Moher. Le centre de journalologie est à Ottawa et a […]
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La recherche chirurgicale s’adapte trop lentement aux pratiques de la science ouverte

Par : Herve Maisonneuve
C’est une courte lettre de recherche dans JAMA surgery en décembre 2023 évaluant l’adoption de la science ouverte par les milieux académiques. Désolant car le retard est grand par rapport à certaines disciplines. Ce sont 8 journaux de chirurgie qui ont été analysés : JAMA Surgery, Annals of Surgery, British Journal of Surgery, Journal of […]
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Cas IS n° 10 : Ajouter des auteurs de complaisance pour faciliter l’acceptation de mon article

Par : Herve Maisonneuve
Retour en France pour continuer des recherches Vous avez passé deux ans aux Etats-Unis dans un labo prestigieux avant de revenir en France. Le directeur de l’institut de recherche supervise plusieurs départements et environ 1000 chercheurs. Vous ne l’avez jamais rencontré. Vous êtes enthousiaste au vu des résultats d’expériences récentes. Ils seront acceptés dans une […]
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Faut-il accepter l’IA pour générer les images des articles scientifiques ? Controverses

Par : Herve Maisonneuve
L’intelligence artificielle (IA) aide les auteurs et la plupart des instructions des revues acceptent que l’IA soit utilisée. Une condition : il faut préciser ce qu’a fait l’IA dans les méthodes ou des annexes, voire ajouter les prompts (requêtes). Dans le domaine des images, rien n’est consensuel car des revues refusent totalement l’utilisation de l’IA, […]
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Quel traducteur choisir pour passer du français à l’anglais ? CUBBITT légèrement meilleur que DeepL et Google Translate

Par : Herve Maisonneuve
Cet article de PLOS ONE publié en février 2024 rapporte une recherche faite par deux chercheurs suisses (Genève). J’utilise parfois ces traducteurs et j’ai constaté que je diminuais (correction faite pour enlever la faute) légèrement les fautes de grammaire. En bref, les méthodes : ‘Then, in spring 2022, we selected all MTs allowing the translation […]
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Cas IS n° 9 : Ajouter des références à la demande du rédacteur en chef

Par : Herve Maisonneuve
Situation réelle… j’ai vu la lettre !! Très nord-américain !!! Enfin mon manuscrit a été accepté par une revue prestigieuse Le manuscrit de ma recherche vient d’être accepté après plusieurs commentaires et échanges avec les relecteurs (peer-review)… cela a pris beaucoup de temps et demandé des analyses complémentaires. Le rédacteur en chef vient de m’envoyer […]
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L’intelligence artificielle (IA) est là pour rester : il faut apprendre à l’utiliser pour écrire nos articles

Par : Herve Maisonneuve
L’intelligence artificielle (IA) diminue le temps pour écrire une revue de la littérature mais demande une vérification importante des faits. Les combats entre les ‘pros and cons’ n’ont plus lieu d’être ! Nous l’avons vu dans le billet d’hier. Cet article de décembre 2023 dans la revue ‘Current Osteoporosis Reports’ est une recherche de plus […]
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Revue de littérature écrite avec ChatGPT… pas encore satisfaisant mais exercice prometteur

Par : Herve Maisonneuve
Dans la revue Anesthésie & Réanimation, en janvier 2024, une expérience d’auteurs marseillais écrivant avec l’intelligence artificielle (IA). Bon article qui montre les limites et avantages d’utiliser ces logiciels. Si en 2024, il y a beaucoup de limites, elles vont être progressivement corrigées. L’article de ChatGPT, les commentaires des auteurs et le prompt L’article est […]
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Les nombres moyens d’auteurs par article augmentent toujours… de 4 à 6 en 20 ans

Par : Herve Maisonneuve
Cet article de Scientometrics en décembre 2023 a 30 pages (format PDF), et sa lecture est agréable. Les auteurs sont autrichiens et le titre est :  How many authors are (too) many? A retrospective, descriptive analysis of authorship in biomedical publications Entre 2000 et 2020, PubMed a indexé 17 millions d’articles (il y en a […]
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La rédaction pour la recherche en santé : merci pour les commentaires élogieux

Par : Herve Maisonneuve
Des collègues ont pris la peine d’écrire des analyses de notre ouvrage paru fin 2023. Je les remercie tous sans pouvoir tous les citer. Voici quelques analyses ci-dessous. CNOM et Académie Le bulletin du Conseil National de l’Ordre des Médecins (CNOM) adressé à toute la profession. C’est en page 7 du numéro 88 de fin […]
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Cas IS n° 8 : Quel rôle pour le financeur de notre recherche ?

Par : Herve Maisonneuve
Quelle dépendance vis-à-vis du financeur ? Nous avons accepté un financement externe pour évaluer les effets psychologiques de certains produits de grande consommation. Cette manne financière sera utile pour assurer la pérennité  de notre équipe de recherche. Nous avons convaincu le représentant de la société commerciale XX d’apporter ce financement après plusieurs réunions cordiales. Nous […]
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La cas Sato pas terminé en 10 ans : Journaux et Institutions collaborent mal pour analyser les méconduites et prendre des décisions

Par : Herve Maisonneuve
C’est une news de Science en janvier 2024 qui reprend un article de décembre 2023 dans Accountabilty in Research concernant le cas Sato. Ten Years later: Assessments of the integrity of publications from one research group with multiple retractions. Un énorme travail avec de nombreuses publications Depuis 2012, Andrew Grey (Département de médecine, Auckland, New […]
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The predatory paradox : un livre qui décrit une recherche sur les journaux prédateurs, à partir de 48 interviews

Par : Herve Maisonneuve
C’est un livre important paru fin 2023 et que vous pouvez acheter (format papier) ou télécharger gratuitement (format PDF). Ce livre de 284 pages a été écrit par des chercheurs américains, essentiellement de Texas University. Il s’agit d’une recherche financée par la National Science Foundation et il y a eu 48 interviews (17 pays représentés, […]
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Instructions aux auteurs concernant l’utilisation de l’intelligence artificielle dans les articles

Par : Herve Maisonneuve
Cet article du BMJ le 31 janvier 2024 est de bonne qualité, et intéressant. Article en accès libre, comme tous les articles de recherche du BMJ, mais éditorial sous paywall ! Si j’avais été relecteur, je me serai opposé à l’inclusion d’environ 30 éditeurs prédateurs parmi l’échantillon de 100 éditeurs. Les instructions sur l’utilisation de […]
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Les pratiques frauduleuses des paper mills : payer des rédacteurs en chef pour accepter des articles

Par : Herve Maisonneuve
Cet article (news) publié le 19 janvier 2024 dans Science décrit des fraudes majeures avec des exemples très précis. Nous avons souvent évoqué les ‘paper mills‘, ces sociétés qui écrivent, reprennent, inventent des articles et proposent à des chercheurs de les signer, contre payement bien sûr. Le phénomène est mal connu, mal décrit et semble […]
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Cas IS n° 7 : Usurpation d’identité parmi les auteurs d’un article publié dans une revue très prestigieuse

Par : Herve Maisonneuve
Des règles d’auteurs décrites dans le protocole, mais un bon à tirer signé par un collègue ! Je suis engagée dans une recherche clinique internationale avec d’autres équipes (8 pays), et un article a été accepté dans l’une des cinq revues médicales les plus prestigieuses. Il avait été convenu que chacune des 8 équipes aurait […]
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Les dures leçons de Wiley qui nettoye Hindawi : des milliers de rétractations d’articles de numéros spéciaux

Par : Herve Maisonneuve
C’est un document de 17 pages pour décrire le tsunami qui a conduit à probablement 8000 rétractations d’articles. Ce sont essentiellement des articles de numéros spéciaux avec des Guest Editors. Hidawi, historiquement d’origine égyptienne, s’était relooké en déménageant à Londres avec l’embauche de rédacteurs professionnels. In fini, les journaux qui restent de qualité vont être […]
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Comparaison des pays pour des auto-citations de 1996 à 2019

Par : Herve Maisonneuve
Cet article de 33 pages a été publié dans PLOS ONE en décembre 2023. A global exploratory comparison of country self-citations 1996-2019 Voici la traduction en français du résumé : ‘Les autocitations sont un sujet clé de la bibliométrie évaluative car elles peuvent gonfler artificiellement les indicateurs de performance liés aux citations. Récemment, les autocitations […]
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Cas IS n° 6 : Quelle est l’influence du financeur d’un projet de recherche ?

Par : Herve Maisonneuve
Supprimer des données pour embellir J’ai un rendez-vous avec le directeur du laboratoire qui a apporté les financements pour ma recherche. En discutant, il devient clair que mes résultats ne supportent pas les objectifs de mon directeur, ni ceux du financeur que je n’ai pas rencontré. Mon directeur me demande de supprimer des résultats. Il […]
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Science ouverte : les médecins ne sont pas prêts… situation plutôt très inquiétante car ils ne savent pas ce qu’est le partage des données et ont peur des preprints !

Par : Herve Maisonneuve
Désespérant ! Il existe des enquêtes explorant l’appétence des chercheurs pour la science ouverte, mais il n’y en a pratiquement aucune en médecine. En médecine depuis plus de 20 ans, il existe des données, des opinions estimant que 85 % de la recherche est du gaspillage. La science ouverte est une opportunité pour améliorer la […]
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Le numéro de Noël du BMJ : Barbie, Doctor Who, et autres articles sérieux sur des sujets peu sérieux

Par : Herve Maisonneuve
Comme d’habitude, le dernier numéro de l’année du Brisitsh Medical Journal est le Christmas BMJ (décembre 2023). Plein d’articles divers souvent humoristiques. La couverture présente le/la Dr Barbie, noire avec un vitiligo, mais engagée contre le tabac, étant pneumologue. Cette couverture illustre un article intitulé ‘Analysis of Barbie medical and science career dolls: descriptive quantitative […]
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50 000 articles rétractés dont 10 000 en 2023 : la partie émergée d’un iceberg… immense ?

Par : Herve Maisonneuve
C’est une news de Nature (Richard Van Noorden) en décembre 2023 qui apporte quelques informations sur les rétractations d’articles. Hindawi : 8 000 rétractations en 2023 L’année 2023 a été particulière car ce sont plus de 10 000 rétractations d’articles qui ont été observées. La plupart, environ 8000 proviennent du groupe Hindawi (acheté par Wiley). […]
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Battage médiatique avec un langage promotionnel : interprétation subjective des preuves… pratique fréquente

Par : Herve Maisonneuve
Qui d’entre nous n’a jamais, dans un article, utilisé des mots ayant l’objectif d’embellir des résultats piteux, ou tout simplement des résultats de qualité qu’il faut faire briller ? Que faire devant ces pratiques communes d’embellissement des informations ? C’est un travail de longue haleine qui nous apporte des données solides. Il y a 4 […]
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Cas IS n° 5 : Modifier la dose du produit testé en cours de l’expérimentation

Par : Herve Maisonneuve
Protocole de recherche avec une dose insuffisante du produit testé J’étudie les relations entre de microdoses de champignons hallucinogènes et la créativité chez l’homme. L’investigateur principal a obtenu l’accord du comité de protection des personnes (CPP). Après les premières expériences lors d’un festival de musique, mon superviseur me fait remarquer qu’il faudrait utiliser une dose […]
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‘Sexe et genre’ & ‘Pollution des sols agricoles’ : sujets difficiles bien exposés dans Science et Pseudo-sciences de janvier 2024

Par : Herve Maisonneuve
Le numéro 147 de Science et Pseudo-sciences est arrivé. Le sommaire est ici, et vous pouvez télécharger le dossier de presse sur le site. Deux gros dossiers. Le dossier ‘Sexe et genre’ D’abord deux chapitres qui font le point : ‘De quoi parle-t-on ?’ et ‘Quelles conséquences dans les débats de société ?’. En fait […]
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Bonne ressource : COAR pour Confederation of Open Access Repositories

Par : Herve Maisonneuve
Confederation of Open Access Repositories (COAR) Le site de COAR est riche en informations utiles.Ce site veut répertorier toutes les plateformes permettant d’archiver des documents. Je cite : ‘COAR is an international association with over 130 members and partners from around the world representing libraries, universities, research institutions, government funders and others. COAR brings together […]
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Les prix du SPEPS 2023 : Prix Éditorial de la Presse et de l’Édition des Professions de Santé

Par : Herve Maisonneuve
Comme chaque année le SPEPS (Syndicat de la Presse et des Editions des Professions de Santé) a attribué ses prix. Le site du SPEPS liste tous les lauréats et vous permet de télécharger une plaquette avec tous les nominés et lauréats. Il donne accès aux pdf des 16 articles primés. Lors de la remise des […]
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Crise de l’édition et de la gestion des savoirs : les dangers des revues de faible qualité

Par : Herve Maisonneuve
La chaine YouTube de Santé Sorbonne Université est une bonne ressource avec la mise en ligne de conférences. Vous pouvez y accéder facilement. Qui gère le savoir ? Des acteurs mercantiles ? Je remercie le doyen Bruno Riou pour m’avoir invité pour faire l’une des conférences mensuelle. B Riou a animé la discussion nous permettant […]
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Cas IS n° 4 : Répondre à un appel à projet en ayant perdu des données préliminaires

Par : Herve Maisonneuve
Pertes de données sources Vous êtes en train de finir la rédaction d’un protocole pour répondre à un appel à projet d’une agence de recherche ; vous devez l’envoyer dans deux jours. Les idées sont bien développées, et les hypothèses basées sur des expériences préliminaires prometteuses. Hier, votre ordinateur a eu des problèmes et vous […]
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