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Utiliser les IA en recherche : recommandations bienvenues de la plupart des agences et autorités

Tout va vite et la plupart de nos organisations mettent en place des directives pour leurs personnels pour les aider à intégrer les IA (Intelligences Artificielles) génératives dans leurs activités. C’est une période de foisonnement en attente d’une gouvernance capable d’harmoniser tous ces documents. Ne soyons pas pressés car si c’est le sinistre actuel de […]

Quels impacts de l’IA sur le peer review ? Danger ! Controverses… pour ou contre ?

C’est une sorte de prise de position de deux anciens rédacteurs en chef de journaux du groupe JAMA. Notons qu’ils ne publient pas dans le JAMA, ce qui semble sage…   Des revues n’acceptent pas les articles des membres de leurs comités de rédaction…  c’est une politique raisonnable. IA et évaluation des manuscrits : INTERDIT pour […]

Aix Marseille Université ne connait pas la transparence : cacher les fraudes est réussi

Encore des trucs surprenants qui montrent que le nettoyage suite au scandale hydroxychloroquine dans la COVID-19 est loin d’être fini. L’histoire expliquée dans l’Express en novembre 2024 illustre le manque de transparence et d’intégrité au niveau de la présidence d’Aix-Marseille Université (AMU). Ne nous étonnons pas de voir l’intégrité scientifique bafouée par les présidents des […]

Le 10ème Peer Review Congress en septembre 2025 : soumettez vos abstracts

Chicago est la ville du Peer Review En terme de recherche éditoriale, de journalologie, c’est l’un des meilleurs rendez-vous entre rédacteurs de revues et chercheurs en métascience. Le premier congrès s’est tenu à Chicago (siège de l’AMA, American Medical Association, propriétaires des journaux du groupe JAMA) en 1989 et ensuite tous les quatre ans, avec […]

Les usurpations d’identités, d’affiliations existent dans la littérature scientifique

C’est un rapport de STM bienvenu et très détaillé sur un sujet peu exploré. Ce rapport (titre ci-dessous) a été publié en octobre 2024. L’ancien temps : la confiance…  un concept obsolète ? Voici la traduction du premier paragraphe du résumé du rapport : Pendant des siècles, l’édition universitaire a fonctionné sur la base de […]

La coercition des références : plus fréquent que l’on ne le croit

J’ai vu beaucoup de lettres de rédacteurs en chef demandant de citer des articles. L’art de la citation est une discipline très pratiquée qui conduit à répandre des dogmes, de fausses idées, etc…  mais rédacteurs et auteurs aiment ce sport qui contribue à augmenter les facteurs d’impact des revues. Ajouter 12 articles parmi les citation […]

Nouvelle stratégie pour le groupe PLOS : plus de FTAs et l’article n’est plus le seul produit de la recherche

Une annonce très ambitieuse par le groupe PLOS en octobre 2024. Deux objectifs : l’article n’est plus seulement un manuscrit simple, et les FTAs (ou APCs) sont un modèle économique à abandonner. Les informations sont : sur le blog de PLOS et bien explicitées, sur le blog Science ouverte de l’Institut Pasteur. Je vous suggère […]

L’IA pourra bientôt faire vos études qualitatives… gain de temps OUI, qualité des résultats à voir !

C’est un billet du blog de LSE (London School of Economics and Political Science) qui nous informe sur des développements qui devraient bientôt nous aider. Le titre du billet est attirant : AI can carry out qualitative research at unprecedented scale. Deux auteurs, un allemand, un français qui travaillent à la LSE. L’IA pourra faire […]

Publication Integrity Week : bonne initiative online avec les meilleurs experts

Nous connaissons ces évènements organisés sur une semaine et qui permettent des discussions avec les meilleurs experts. Les modalités d’organisation varient. L’open access week est l’évènement le plus ancien organisé par SPARC depuis 2008. En 2024, c’était du 21 au 27 octobre avec pour thème ‘La communauté avant la commercialisation’. Ce sont des actions en ligne […]

Comment écrire ? Un bijou de Pierre Assouline pour ceux qui aiment écrire et lire

C’est un ouvrage d’un érudit, Pierre Assouline, qui a repris ses 25 ans de cours à Science Po. Ce livre paru le 25 août2024 chez Albin Michel concerne la rédaction littéraire..  mais avec de nombreux messages adaptables pour la rédaction scientifique. Il sera utile pour qui écrivent des romans, des poèmes voire des articles scientifiques. […]

Des complotistes n’admettent toujours pas que l’hydroxychloroquine ait causé des décès

Dans un billet du 1 novembre 2024, RetractionWatch (RW) relate la scandaleuse rétractation d’un article émettant l’hypothèse que l’hydroxychloroquine (HCQ) aurait provoqué des décès pendants la pandémie COVID. Estimation : entre 6 300 et 19 300 morts dus à l’HCQ en 2022 sur 6 pays J’ai présenté ce bon travail d’une équipe lyonnaise qui a […]

Où vont les publications des Sociétés savantes ? En diminution ? Des orientations à partir d’une étude au Royaume Uni

Quel avenir pour les publications des sociétés savantes ? Une étude (15 octobre 2024), publiée par UKSG (United Kingdom Serials Group) journal, apporte des pistes de réflexion. Son titre : You don’t know what you’ve got till i’s gone: the changing landscape of UK learned society publishing. Ce titre est partiellement emprunté à une chanson […]

Naviguer au sein du peer review : diversité, IA, etc.. par la rédactrice en chef du Lancet

Très nombreux évènements lors de la Peer Review Week 2024 qui a été organisée en septembre…  Il y a énormément de vidéos disponibles. En juin 2024, Cactus communication a publié l’interview de Joan Marsh, vidéo mise sur YouTube, et reprise ci-dessous. Un résumé (traduit) Dans cet épisode, Joan Marsh, rédactrice en chef de The Lancet […]

Dans quelles revues scientifiques publient nos maîtres (membres de CME de CHU, doyens, ..) ?

Il faudrait des données probantes pour mieux dialoguer avec nos collègues ! Je suis périodiquement confronté à des discussions autour d’opinions…  et des données seraient utiles. Revues prédatrices, de piètre qualité et de qualité L’UNESCO classe les revues scientifiques en trois groupes, tout en signalant deux points : 1) il existe des zones grises entre […]

Numéro 350 de S&PS. Alimentation : les inquiétudes sont-elles fondées ? Former à l’esprit critique.

Le numéro octobre / décembre 2024 de Science & Pseudo-sciences est en kiosque. C’est le journal de l’Association française pour l’information scientifique et il est proposé par un comité de rédaction volontaire. Ce sont 144 pages sans publicité pour 6 €. Rappelons que la plupart des articles sont mis en ligne entre 3 et 6 […]

Déclaration d’Helsinki : arrêtons les plaisanteries de type hydroxychloroquine

Nous avons présenté la nouvelle version de la Déclaration d’Helsinki intitulée : Principes éthiques applicables à la recherche médicale impliquant des participants humains. Arrêtons les gaspillages en recherche La DoH est timide sur les gaspillages, mais un article contient une nouvelle phrase : Si de nouvelles connaissances et interventions peuvent s’avérer nécessaires dans les situations […]

Déclaration d’Helsinki : une révision pour le 21ème siècle

Nous avons présenté l’actualisation 2024 de la DoH (Declaration of Helsinki) avec 10 articles dans le JAMA. Quelques uns de ces articles méritent lecture. Kirsten Bibbins-Domingo, rédactrice en chef du JAMA, avec ses adjoints, a présenté cette nouvelle version dans un éditorial en commentant les articles du JAMA accompagnant la publication de la DoH : […]

Actualisation 2024 de la déclaration d’Helsinki : ‘participants’ remplace ‘sujets’, et arrêtons les recherches raoultiennes

C’est le JAMA (19 octobre 2024) qui a l’honneur de publier une série d’articles sur une mise à jour en 2024 de la Declaration of Helsinki (DoH). La DoH est une texte de l’Association médicale mondiale (WMA, World Medical Association) publié en 1964 et périodiquement amendé (dernière fois en 2013). Ce sont des recommandations pour […]

La pression sur l’édition scientifique : plus d’articles publiés avec nombre constant des chercheurs ! Cherchez l’erreur

J’ai bien aimé un article de L’Express (29 septembre 2024) qui traduit la réflexion de son auteur (A Beau). Le titre repris ci-joint est bien fait. Il y a de bonnes iconographies à méditer. Cet article a probablement demandé beaucoup de travail pour rendre lisible des messages publiés le 3 septembre dans QSS par quatre […]

Quelles sont les conditions de travail chez les éditeurs prédateurs et de piètre qualité ?

Nous supposons que les éditeurs de revues prédatrices étant basés dans des pays où les droits du travail sont souples, les conditions de travail sont mauvaises. Pour des éditeurs de piètre qualité, basé parfois en Europe ou en Suisse, je supposais que les conditions étaient meilleurs. Sans données objectives, difficile de se prononcer… mais…. Un […]

Peer-review : est-ce que l’IA pourrait se substituer aux relecteurs ? Controverses

C’est une question à laquelle je ne sais pas bien répondre. Pour l’instant, comme d’autres collègues et institutions, je suis réservé voire opposé à l’utilisation de l’IA pour évaluer des manuscrits. Nourrir des IA avec des manuscrits non validés ne me semble pas acceptable…  Mais l’IA peut relire et l’IA sera utilisée par certains éditeurs…  […]

Les liens d’intérêts des relecteurs des journaux prestigieux : la transparence ne semble pas être la norme

Peu de données existent sur les liens d’intérêts des relecteurs de manuscrits de recherche. Le peer-review est une activité opaque. Des revues demandent aux relecteurs de déclarer leurs liens d’intérêts : est-ce analysé et par qui ? Les lecteurs n’ont aucune information sur les relecteurs, et encore moins sur leurs liens. Une courte lettre de […]

Chercheurs quittant la science : 1/3 après 5 ans, 50 % après 10 ans et 2/3 après 19 ans

Les femmes quittent la science plus tôt que les hommes Le titre de ce billet reprend l’information principale, obtenue sur de grands effectifs et en ajoutant que les femmes quittent la science plus tôt que les hommes. C’est une news dans Nature qui commente un énorme article…  travail impressionnant avec pour titre : Quantifying attrition […]

Les préprints sont aussi fréquents pour les articles des revues de médecine que pour les autres domaines scientifiques

Des préprints ont existé pour 7,4 % des articles de recherche publiés par 23 revues à haut facteur d’impact Voici la traduction (merci DeepL) du paragraphe ‘Résultats’ d’une lettre de recherche publiée fin juin 2024 par JAMA Network Open : Parmi les 5 739 articles de recherche publiés dans 25 revues à facteur d’impact élevé […]

Le collège invisible : Réunion des membres du projet NanoBubles

Le collège invisible Voici le début d’un article du Monde Sciences (2 octobre 2024) par David Larousserie : ‘Ils sont venus à Paris de Nouvelle-Zélande, d’Australie, des Etats-Unis, d’Allemagne, de Suisse ou de Majorque. Ils et elles sont les membres de l’autobaptisé « Collège invisible », groupe d’experts scientifiques à la sauce Avengers ou Ligue des gentlemen […]

Les visions « naïves » de l’esprit critique… savez-vous définir l’esprit critique ?

Nous savons tous ce qu’est l’esprit critique et en général nous pensons en avoir plus que les personnes croisées. Mais savons nous définir et expliquer ce concept ? Il s’agit d’une bonne conférence faite lors des REC (Rencontres de l’Esprit Critique) de Toulouse en avril 2023. Conférence faite par Florian Cova sur le travail d’une […]

Un antivax est ministre de l’enseignement supérieur et de la recherche : à suivre

Sur un certain nombre de médias, mais pas sur les médias complotistes, la personnalité de Patrick Hetzel, nouveau ministre de l’enseignement supérieur et de la recherche (MESR). Un fana de l’hydroxychloroquine, de l’ivermectine et du zinc dans la Covid-19 Je reprends le tweet du 2 avril 2020 qui était accompagné de la copie de la […]

Il vaudrait mieux faire des ‘mega-essais’ plutôt que de ‘petits essais’ qui sont souvent favorables au produit testé

Très gros travail publié le 6 septembre 2024 dans JAMA Network Open avec pour titre : Agreement Between Mega-Trials and Smaller Trial. A Systematic Review and Meta-Research Analysis. Un preprint avait été déposé sur medRxiv en mai. Très gros article (21 pages format PDF) avec 10 auteurs et des affiliations de 6 pays (USA, Suisse, […]

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Cette news de Nature de septembre 2024 commence ainsi : « Un générateur d’idées alimenté par l’intelligence artificielle (IA) a produit plus d’idées de recherche originales que 50 scientifiques travaillant indépendamment, selon un manuscrit déposé sur arXiv. » Qu’en penser ? Effrayant ou rassurant ? Un preprint a été déposé le 6 septembre sur cette recherche.

Papers mills, review mills et citation mills : est-il possible de lutter contre ces fraudes ?

Trois pratiques mafieuses, bien expliquées sur le blog anonyme Predatory Journals (février 2024) et celui de l’Institut Pasteur Open Science (juin 2024) Ces trois pratiques sont parfois complémentaires. L’image ci-dessous est empruntée au blog Predatory Journals. 1) Paper mills J’ai souvent évoqué les paper mills, à savoir ces sociétés de service qui écrivent des articles, […]

Les procédures baîllons de D Raoult ont toutes été des échecs : le faire savoir

Une procédure-bâillon est une action en justice visant à intimider et à faire taire un journaliste, démystificateur ou lanceur d’alerte ou à entraver la participation politique et le militantisme (wikipédia). S’agit-il de la stratégie de Didier Raoult pour faire taire ceux qui ne sont pas de son avis ? Bonne vidéo de la Tronche en biais […]

Protéger l’intégrité scientifique à l’âge des IA génératives : les chercheurs ne doivent pas être seuls responsables

Le titre de cet éditorial paru en mai 2024 dans PNAS semble recycler des banalités, mais ce n’est pas le cas : Protecting scientific integrity in an age of generative AI. Nous savons que la plupart des acteurs de la recherche attirent notre attention sur une utilisation responsable des IA génératives. Nous avons évoqué les […]

Etats généraux de l’information : bons rapports mais aucune reconnaissance des sources scientifiques primaires

En septembre 2024, ont été émis deux rapports avant dépôt d’un projet de loi. Ne crions pas victoire car les algorithmes ont pris le pouvoir et l’objectif serait de le reprendre. Ces bonnes initiatives n’ont pas considéré les revues scientifiques, ignorent donc les sources primaires d’information en science. C’est probablement normal, car certaines propositions renvoient […]

L’appétence de nos collègues pour les revues mercantiles, ou de complaisance, ou de piètre qualité

Si Cabells recense plus de 16 000 revues prédatrices, si STM estime qu’il existerait 35 000 revues sceintifiques en anglais à comité de lecture (domaine STEM Science technologie engineering et médecine, sans considérer les SHS Sciences humaines et sociales), combien y-a-t-il de revues de piètre qualité ? Je ne sais pas mais plusieurs milliers probablement…. […]

‘Frauduleux’ ‘Piètre qualité’ et ‘Qualité’ : les revues scientifiques peuvent être classées en trois groupes

J’ai évoqué hier les revues de piètre qualité sans m’expliquer…  voici les informations Il n’y a pas que les revues prédatrices Nous avons présenté en avril 2022 un rapport de IAP (The InterAcademy Partnership), à savoir le réseau d’environ 150 Académies des sciences. Ce rapport, avec un résumé en français, avait pour titre ‘Lutter contre […]

La rétractation rocambolesque de l’article estimant que l’HCQ a tué des malades : ne laissons pas les complotistes nous menacer

J’ai présenté en janvier 2024 cet article estimant que l’hydroxychloroquine (HCQ) avait causé la mort de 17 000 personnes sur 6 pays de mars à juillet 2020. Un article honnête reconnaissant ses limites J’ai apprécié cet article qui donnait une estimation, un range (6 à 19 000), et surtout n’incluait pas les données non hospitalières […]

La lutte interminable contre les revues prédatrices : la déclaration de Sydney devrait être reprise par nos institutions

Il s’agit d’une déclaration de l’APAME (Asian Pacific Association of Medical Journal Editors) publiée sous forme d’éditorial dans le numéro de septembre 2024 du MJA (Medical Journal of Australia). Le titre est repris ci-dessus. Cette déclaration a été adoptée lors du congrès APAME de fin août 2024, à Newcastle, Australia. Les signataires de l’éditorial Ce […]

Bravo à l’IHU et à l’AP-HM qui signalent les méconduites de D Raoult et P Brouqui

Félicitons tout d’abord Le Point et le journaliste Olivier Hertel qui ont mis en ligne le 5 septembre 2024 à 16 h 17 cette information. De nombreux médias passent sous silence les échecs réitérés de D Raoult et autres pieds nickelés. Voici le titre du Point qui mentionne des recherches illégales : Un article dans une […]

Les plagiats d’Etienne Klein sont nombreux, mais les protections existent… Taisez-vous !

C’est une excellente enquête de deux journalistes (Loris Guémart et Jean Abbiateci) publiée le 5 août 2024 sur le bon site ‘Arrêt sur images’. Le titre « Etienne Klein, une thèse constellée de plagiats« . Article offert par les abonnés. Etienne Klein a été accusé de plagiat, et comme tout plagieur, il faut remonter aux sources, ici […]

De nouvelles revues en gestation pour profiter du cascading !

Nous avons trop de revues et en même temps, le marché prospère. Ci-dessous, des exemples de créations de revues annoncées cet été…  on pourrait trouver beaucoup d’exemples. Par contre, j’ai l’impression que peu de revues disparaissent ! Ces stratégies sentent le ‘cascading’ bien connu chez des éditeurs de complaisance : mieux vaut transférer un manuscrit […]

COVID / HCQ : encore des affirmations non fondées sans audit ni avis de tiers indépendants

Pourquoi agresser des chercheurs honnêtes qui ne demandent qu’à montrer leurs données et répondre aux controverses ? Cet article d’une bonne équipe Lyonnaise émet l’hypothèse que l’hydroxychloroquine a tué des malades. J’ai exposé cet article qui a été rétracté car la revue a pris peur devant des menaces de pseudo-experts que les universités devraient dénoncer… […]

Manipulation des images : les 20 ans du premier article sur ce sujet

C’est un long billet de Retraction Watch à l’occasion de l’anniversaire (20 ans) de l’article de JCB (Journal of Cell Biology) par ses rédacteurs de l’époque. Le titre était : What’s in a picture? The temptation of image manipulation. Les premières descriptions de manipulations d’images en biologie Je reprends ci-contre l’une des illustrations de cet […]

Les challenges de la publication scientifique dans le domaine des sciences de la terre et de l’espace

Il est toujours utile d’aller voir les comportements de collègues dans d’autres domaines scientifiques. Cet éditorial dans AGU Advances de juillet 2024 apporte des réflexions connues et partagées. C’est une alerte pour proposer une reprise en main des Sociétés savantes. L’AGU (American Geophysical Union) est l’union américaine de géophysique, association non-profitable, basée à Washington avec […]

Les dérapages des revues mercantiles de complaisance : cas de Biomedicine & Pharmacotherapy

J’ai été étonné par la rétractation le 23 août 2024 d’un article émettant l’hypothèse que l’hydroxychloroquine avait causé la mort de 17 000 patients traités pour un COVID-19. J’avais évoqué cet article dans un billet du 9 janvier 2024. Je reviendrais sur cette histoire troublante, et la presse grand public commence à en parler : […]

Le marché noir des citations : il existe mais quels en sont les risques ?

Il s’agit d’une news du 20 juillet dans Nature qui décrit les différentes possibilités pour manipuler les citations, en augmentant leur nombre dans les articles. L’art de la citation est une pratique d’auteurs ancienne et connue Nous avons souvent décrit ces pratiques d’auteurs qui sont nombreuses. Mais la news de Nature apporte des informations sur […]

Le comportement des gros publiants est inquiétant dans la plupart des domaines scientifiques

C’est Scientometrics qui fin juillet 2024 a publié cet article qui avait été déposé sous forme de preprint sur bioRxiv. Il y a trois auteurs, JP Ioannidis, un gros publiant de Californie, et deux salariés d’Elsevier. Des pratiques peu acceptables mais souvent tolérées par les institutions   Voici la traduction en français du résumé de […]
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