Ce sont des tweets et un communiqué sur le site de MDPI (22 mars 2023) qui ont annoncé la perte du facteur d’impact de revues. Quelques collègues avides de publier vite dans des numéros spéciaux sont un peu chavirés s’ils doivent passer devant un jury : ils étaient prévenus ! C’est un processus habituel chez […]

Une opinion de JPA Ioannidis dans le JAMA, 20 mars 2023, nous apporte des informations sur ce modèle de publication qui met en péril certaines revues légitimes anciennes. Plus de 2 000 articles originaux ou revues de la littérature par an Est considérée comme méga-revue, une revue qui publie plus de 2 000 articles biomédicaux […]

La nouvelle rédactrice en chef du JAMA et du JAMA Network semble changer un peu la maison. Des d’éditoriaux concernent la politique éditoriale du groupe depuis sa nommination, été 2022. Dépôt des manuscrits acceptés sur des archives ouvertes Cet éditorial de décembre 2022 a pour titre : ‘Public Access to Scientific Research Findings and Principles […]

Le Bulletin Officiel du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche du 9 mars 2023 contient une information dont le titre est : ‘Régime de la déclaration d’intérêts préalable à l’exercice d’une mission d’expertise auprès du Parlement et des autres pouvoirs publics constitutionnels par les membres du personnel enseignant et hospitalier des centres hospitaliers […]

C’est un court article du 19 février 2023 argumenté sur la pratique des publicités dans les revues médicales. Il y a des informations sur les revenus des grands éditeurs. Ceux qui proposent d’avoir de la publicité disent que les revenus sont utiles et que la publicité informe les cliniciens sans influencer leurs pratiques. Ce dernier […]

Que penser d’une discussion sur la liste de EASE (European Association of Science Editors) ? La voici : Dear collegues, I have a conflicting situation with my manuscript jourmey which I would like to share and hear your feedback. Me and my colegues wrote a paper 2 years ago and submitted to a journal. One […]

Plus besoin de revenir sur le fait que les liens d’intérêts influencent les comportements. De nombreux congrès imposent aux présentateurs d’avoir une diapositive (après celle du titre) rapportant les liens d’intérêts. Plus la diapo est chargée, plus elle est illisible, plus elle passe vite ! C’est une étude simple faite par deux écossais lors d’un […]

Lors de formations avec des chercheurs et doctorants dans les domaines biologie, agronomie, écologie, informatique, médecine, etc… j’incite les participants à lire des articles de domaines comme marketing, sciences sociales, sociologie, juridique, etc… La première étape est d’essayer de comprendre que les domaines STM et SHS ont des pratiques de rédaction assez différentes. Ensuite, comprendre […]

Note : le 31 mars 2023, j’ai rajouté une note sympa en bas de ce billet. Dans Le Monde du 1 mars 2023, j’ai lu la tribune intitulée ‘Les patients atteints de cancers doivent avoir accès à l’innovation thérapeutique‘ sous-titre ‘Le médecin Hervé Avet-Loiseau et le patient Laurent Guillot s’insurgent contre l’interdiction par la Haute […]

Ce qui est clair pour un article : plus il y a d’auteurs, plus c’est compliqué ! Google Docs pour gérer tous ces auteurs ! Les réflexions sont dans un article de Nature daté du 2 mars 2023, avec le titre dans l’image ci-contre. L’expansion du nombre d’auteurs est incroyable. L’exemple du boson de Higgs […]

Le Journal of Clinical Epidemiology a publié (février 2023) un article sur les collaborations et les réseaux d’auteurs de lignes directrices du réseau EQUATOR. Ce réseau contient 555 lignes directrices au 25 février 2023. Les auteurs de cette recherche ont inclus d’autres lignes directrices, toujours dans le domaine de la santé. 4722 auteurs ont contribué […]

‘Nous proposons une autre approche pour attribuer la qualité d’auteur dans les articles scientifiques. Nous soutenons que l’on devrait savoir qui a pensé à chaque idée, qui a mené chaque expérience et qui a analysé les données. Pour y parvenir, nous proposons deux méthodes faciles à mettre en œuvre qui pourraient changer fondamentalement la façon […]

Grande décision de la revue Nature en février 2023 avec l’adoption des RRs. A Registered Report is a scientific paper that a journal commits to publishing if the research question and the methodology chosen to address it pass peer review. Nous avons plusieurs fois milité pour ce modèle de publication adopté par 300 revues depuis […]

Indépendamment du cas du Cnrs ci-dessous, c’est un système français qui tolère et ne condamne pas les fraudeurs… Pire les lanceurs d’alerte peuvent être mis en cause… Pire encore, des référents intégrité pourraient protéger les institutions !!! Je cite les faits avant de référencer l’initiative de collègues étrangers qui s’étonnent de la tolérance française des […]

C’est la loi de la science : les études stériles n’ont pas la médiatisation des pseudo-études des gourous divers et variés. La preuve scientifique demande du temps pour avoir des données probantes… mais cela n’intéresse pas les médias. Notons surtout que contrairement à ce que disent de nombreux collègues, les revues scientifiques publient des études […]

J’ai largement commenté des présentations du PRC9 en septembre 2022. Viennent d’être mises en ligne, en accès libre, toutes les vidéos des présentations ainsi que des pdf de posters. Très bien fait et agréable de revoir certaines présentations. Une ressource importante sur le fonctionnement des revues Attention, contrairement aux abstracts usuels de congrès, ce sont […]

Article de Nature du 16 janvier 2023 dont le titre est repris ci-contre (article de 15 pages en accès libre). J’ai traduit le résumé en français : Parmi les rédacteurs en chef, 8 % sont des femmes Les rédacteurs scientifiques façonnent le contenu des revues universitaires et fixent les normes dans leur domaine. Pourtant, la […]

J’ai découvert un livre plein d’informations sur les revues scientifiques. Je l’ai lu (non survolé) avec beaucoup de plaisir, survolé car il fait 643 pages ! S’il est téléchargeable gratuitement, j’ai préféré l’acheter pour mieux en profiter. J’ai écouté plusieurs fois Aileen Fyfe, première autrice, et son travail d’historienne est passionnant. Dans ce livre, c’est […]

C’est une belle réflexion d’un journaliste américain publiée dans Nature, sur 3 pages, le 13 février 2023. Le titre sur le site : Stop the peer-review treadmill ! Trouver des relecteurs !!! Il relate toutes les difficultés pour trouver des relecteurs pour les 3 millions d’articles soumis annuellement à des revues scientifiques (2016) ; c’était […]

Trop de thèse sont un transfert d’os d’une tombe dans une autre. Elles plaisent à un vieux jury qui se congratule, mais ne se demande pas si la thèse aura une vie après la soutenance. Une recherche dont les résultats ne sont pas diffusés est un travail perdu. Un travail n’est terminé que quand il […]

Cet article de début 2023 apporte des données originales sur le devenir des articles commentés sur PubPeer, site qui contient environ 100 000 commentaires sur des articles. Le titre : ‘How do journals deal with problematic articles. Editorial response of journals to articles commented in PubPeer‘. Cette recherche a été faite par deux chercheurs en […]

Ce dernier rite de passage doit être bien préparé. La forme (habillement, respect du temps, empathie, clarté) a de l’importance. Une thèse mal présentée met le jury de mauvaise humeur. Un rite de passage codifié par la faculté, et rapide… Les instructions sur la composition du jury sont détaillées et doivent être respectées. Tu as […]

Attention, trop de références sont un étalage de confitures alors que quelques références bien choisies sont très utiles. Ne retiens que des références avec des données probantes pour convaincre, donc essentiellement des articles originaux. 25 à 30 % des références ne contiennent pas ce que l’on leur fait dire Va d’urgence lire un article en […]

Trop de titres de thèse sont peu informatifs et pas très attirants. Il y a trois types de titres : informatifs, indicatifs, interrogatifs. Il faut choisir entres ces trois possibilités… pas toujours facile. Titre actif avec verbe et résultat pour mieux diffuser tes travaux ! Il est possible (voire souhaitable) de mettre un verbe actif […]

Les articles écrits par ChatGPT, ou sur ChatGPT, sont de plus en plus nombreux. Dans la revue Arthroscopy, une courte lettre du 31 janvier 2023 a pour titre : ‘How Will Artificial Intelligence Affect Scientific Writing, Reviewing and Editing? The Future is Here…’. Pourquoi a-t-elle été acceptée et publiée ? Un éditorial écrit par le […]

Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est que le début des festivités. Beaucoup d’article sur ce phénomène, dont un éditorial du JAMA le 30 janvier […]

Nous avons observé la démission de H Bauchner, rédacteur en chef du JAMA, suite à un podcast malencontreux sur le racisme. Un rédacteur en chef : je suis la victime Cette fois-ci, c’est le rédacteur en chef, Klaus Fiedler, de la revue Perspectives on Psychological Science, qui a démissionné. Une lettre ouverte de plus de […]

Le numéro de Science & Pseudo-sciences de début 2023 est dans les kiosques. Sur le site de l’AFIS, vous aurez accès au dossier de presse et au sommaire. Des articles sont présentés dans le dossier de presse (image ci-contre de la page 2). ‘Tests microbiote, Science ou pseudo-science ?’ par Geneviève Héry-Arnaud (Brest) est au […]

Une circulaire du ministère de la santé a du échapper au ministre. La censure est l’apanage de régimes autoritaires… effacer l’histoire n’est pas acceptable dans une démocratie. Ces fonctionnaires ne doivent pas utiliser de passe plat à la cantine (voir image mise en avant avec le passe plat ouvert…  trouvez l’image quand c’est fermé). L’adieu […]

La revue systématique est une recherche qui se développe. Faire une revue systématique (RS) demande du temps, de la rigueur et une collaboration avec des collèges. Bien faite (ce qui est rare), la RS est une recherche qui permet d’analyser la littérature. Il s’agit d’identifier, de sélectionner, d’évaluer et de résumer des études primaires, des […]

Le style scientifique n’est pas le style littéraire. Nous avons appris à bien écrire, dans l’esprit des grands auteurs de la littérature. Urgence, il faut tout oublier en science : Le meilleur style est l’absence de style Comprends comment lisent les chercheurs en science : ils préfèrent ce qui est court, ils vont vite aux […]

Avant de commencer ta thèse, consulte les instructions de ta faculté, des instructions pour bien écrire et autres recommandations Chaque faculté publie sur son site des instructions pour la thèse. Il faut les consulter. Elles sont détaillées pour décrire les formalités administratives, et apportent quelques guides pour la dactylographie et la présentation. Certaines instructions contiennent […]

La mort de la gestion du savoir par les académiques Certains prétendent que les revues de groupes comme MDPI, Frontiers, Bentham, et autres ne sont pas des revues prédatrices ! Ce sont surtout des revues mercantiles. Incroyable, ce sont des universitaires avides de publier vite sans risques d’être refusé par la revue. Payer pour ce […]

Une BD collector J’ai vite acheté la bande dessinée  sur le Mediator écrite et illustrée par Eric Giacometti, Irène Frachon et François Duprat. Félicitons les éditions Delcourt pour cette publication, et la qualité de l’iconographie. Mon libraire de BD du quartier venait de recevoir des exemplaires et je lui ai suggéré de les mettre en […]

Répondre à la question La discussion commence très naturellement par répondre à ta question de recherche. Pour cela, tu résumes brièvement le(s) résultat(s) principal(aux) en mettant en valeur les aspects nouveaux et importants. La thèse, comme l’article original d’une revue scientifique, correspond à deux entonnoirs (intro puis renverse l’entonnoir pour la discussion). L’objectif de la […]

Des temps des verbes au passé ? Le plan IMRaD de ta thèse, ce sont 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (introduction, module 5) ? Comment j’ai fait ce travail (méthodes, module 6) ? Qu’est ce que j’ai observé (résultats, ce module) ? Qu’est-ce que j’en pense (discussion, module 9) ? Note que […]

Une recherche responsable ! Ta recherche doit respecter tous les principes d’une recherche responsable, c’est-à-dire respecter les directives, bonnes pratiques et règles d’éthique qui s’appliquent à la recherche. Tu dois être intègre, en étant totalement honnête, sans cacher des données. Pour les recherches cliniques, considère la loi Jardé en France. Tu dois relire la déclaration […]

La naissance d’une nouvelle revue scientifique est toujours bienvenue et lancer un premier numéro au temps de l’électronique est plus facile qu’envoyer des numéros papiers pour prospecter des clients. Il s’agit d’une revue en accès libre avec pour titre The Journal of Beatles Studies. Génial. Beatlemania L’article 80 to 80 commence ainsi Exactly one week […]

C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : 40 à 60 % des preprints COVID apparaissent dans des revues Dans cette étude, nous avons identifié 3343 preprints liés à […]

La deuxième question du plan IMRaD est : Comment j’ai fait ce travail ? Ce sont les méthodes de ta thèse ou de ton article. Tu dois décrire avec précision comment tu as travaillé, sans omettre tous les détails, mêmes les plus évidents. Ton lecteur devrait pouvoir refaire le même travail. Trois parties qui s’appliquent […]

Le plan IMRaD de ta thèse doit répondre à 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (Introduction) ? Comment j’ai fait ce travail (Méthodes) ? Qu’est-ce que j’ai observé (Résultats) ? Qu’est-ce que j’en pense (Discussion) ? L’introduction est donc un entonnoir et doit être courte.  Sauf si ton directeur te le demande, ne copie pas toutes les […]

T’aider pour préparer une question de recherche. Apprend à poser la question de recherche ; évaluer l’écart entre la littérature et les pratiques : le mieux serait d’avoir une revue systématique (voir module 12) ; la question doit être éthique, nouvelle, intéressante, faisable et pertinente ; PICOT pour : Patient, Intervention, Comparaison, Outcomes, Temps. La […]

Les albums de Tintin ont souvent fascinés des collègues qui ont analysé la place de la médecine dans ces 23 albums. Félicitons JL Vanherweghem et la Revue Médicale de Bruxelles pour l’article paru dans le numéro de novembre-décembre 2022 : L’image de la médecine dans les aventures de Tintin. Cet article sur l’image n’a pas […]

FTA en 2020 en France : 30 millions € C’est un rapport publié le 4 janvier 2023 et accessible sur le site Ouvrir la Science du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Le rapport (57 pages) de décembre 2022 est en anglais et accessible sur HAL. Le rapport évoque les APC (Article Processing […]

Suite à la conférence sur le changement climatique, ce sont plus de 300 revues scientifiques qui ont publié le même éditorial. La liste des revues est ici. Toutes les revues prestigieuses des groupe JAMA, Lancet et BMJ ont publié cet éditorial. Voici, par exemple, la version anglaise du JAMA Psychiatry, ou celle du Lancet. Il […]

Tu auras parfois besoin de soutiens pour rester motivé. Pour réussir ta thèse, l’environnement professionnel et familial compte. Ta formation aux méthodes de recherche et les conditions matérielles de ton travail doivent être prises en compte. Ce module 3 présente quelques informations. De bons outils La recherche documentaire : se faire aider. C’est la première […]

Un bon directeur et c’est gagné Pourquoi faire une thèse ? Par plaisir, pas seulement. Il faut questionner ses collègues pour apprendre de leurs succès et épreuves. Savoir choisir un sujet, un directeur de thèse sont importants. Il faut préparer un rétroplanning (sur 12 mois par exemple) pour éviter le crash final ! Tu disposes […]

Dans ce module 1 du guide du thésard, les principes d’une thèse d’exercice sont présentés. Ce rite de passage se fait dans la souffrance. Les mauvais souvenirs sont vite oubliés. La thèse de médecine et l’article de recherche suivent la même démarche…  mais la formalisation diffère. Il est plus difficile d’écrire un article de 3500 […]

J’ai préparé 16 vidéos de 4 minutes en moyenne pour aider les internes en médecine lorsqu’ils doivent préparer leur thèse. Chaque vidéo sera mise en ligne avec un billet sur ce blog pour la présenter. Avec chaque vidéo, un document pdf de 4 à 8 pages sera téléchargeable avec exemples et références. La définition de […]