La science ouverte (OA pour Open Access) avance bien, et des outils gracieux sont mis à disposition de nos communautés. Un projet européen, DIAMAS, nous apporte des ressources excellentes pour développer les publications modèle diamant. Diamond OA is an equitable model of scholarly publication that charges no fees to authors or readers and in which […]

C’est un billet de Retraction Watch du 17 mars 2025 qui détaille une investigation d’un article.

Cet article du 10 avril 2025 dans Nature Human Behaviour est étonnant car il analyse les discours du Congrès américain et montre que depuis les années 70s, il y a un déclin de la preuve….

C’est une note de la rédaction de PLOS One du 9 mai 2025 qui fait le point sur des articles de l’IHU Méditerrannée Infection et maintient les mises en garde de certains articles. On bon travail des deux parties : rédacteurs de PLOS et représentants de l’université d’Aix-Marseille

Bel éditorial signé anonymement ‘The Lancet’ avec pour titre ‘Supporting medical science in the USA’, daté du 26 avril 2025 Le constat de The Lancet La première phrase de l’éditorial : La poursuite d’une science médicale rigoureuse n’est pas compatible avec une capitulation devant les demandes d’un gouvernement  dont l’objectif est d’attaquer et d’éroder la science. […]

Il s’agit d’un hot paper, à savoir ces articles qui seront beaucoup cités. Il a été publié en février 2025 par une revue des ‘big 5’ en médecine : le British Medical Journal. La couverture médiatique et sur les réseaux sociaux a été importante. L’histoire est détaillée par RetractionWatch (RW) le 18 avril 2025. Il […]

Nous vivons et allons vivre de plus en plus dans ce monde connecté…  car nous laissons des traces en permanence.. pour qui ? pour quoi faire ? Ce livre The secret life of data (MIT Press, 2024) est très complet et ouvre l’esprit. J’ai été impressionné comme en 2005 à la lecture de ‘The world […]

Nous avons présenté un article montrant que les articles retirés de la littérature avaient un impact modeste sur les revues systématiques et méta-analyses. Il s’agissait d’un article de fin mars 2025 dans le JAMA Internal Medicine par une équipe française. The BMJ, un mois plus tard a publié un article dans le même domaine pour […]

Voici un preprint déposé sur Zenodo (29 janvier 2025) qui ne devrait pas être accepté pour publication dans une revue scientifique légitime. Ce preprint a été commenté par DS Chawla dans la revue Nature le 17 avril 2025, avec ce titre : Invasion of the ‘journal snatchers’: the firms that buy science publications and turn […]

Les présentations de la conférence FAIRS ont été plutôt sévère envers ceux qui devraient s’occuper des méconduites. C’étaient des présentations de lanceurs d’alerte car sans eux, la plupart (je dis bien la plupart) des méconduites seraient enterrées…  Lors de sa présentation, Peter Wilmshurst a évoqué ce qu’il a dénoncé, à savoir qu’il a eu des […]

Les rétractations augmentent toujours, mais certaines sont longues à venir…. Une rétractation est un acte vertueux : Bravo… mais… Nous ne pouvons que féliciter les rédacteurs en chef de la revue JNHA (Journal of nutrition, health and aging). Ce journal créé en 1997 est passé de Springer Nature à Elsevier en janvier 2024. JNHA est […]

Cette étude publiée dans JAMA Internal Medicine le 31 mars 2025 confirme des données existantes mais apporte d’autres réflexions. Parmi elles, la surveillance des références à des articles rétractés dans les revues systématiques… et les rédacteurs du groupe JAMA vont ajouter des corrections du type : “This meta-analysis was published before 1 of the included […]

Nous nous réjouissons de l’augmentation lente et régulière des rétractations d’articles dans les revues scientifiques. Une rétractation d’un article de l’équipe Raoult (la 39 ème pour DR) Le Journal of Clinical Medicine (MDPI) vient de retirer de la littérature un article co-signé par D Raoult. La raison est l’absence de comité de protection des personnes. […]

Cette actualisation est bienvenue. La ligne directrice CONSORT (Consolidated Standards of Reporting Trial) a eu un rôle structurant majeur sur la publication des essais randomisés contrôlés par les revues scientifiques. C’est la plus vieille des lignes directrices, proposée dans les années 1990. Il y a eu plusieurs versions (1996, 2001 et 2010) et la ligne […]

Cet article de Nature du 27 mars 2025 apporte des réflexions et des ressources qui alimentent un débat complexe. J’ai toujours pensé que l’évaluation des manuscrits devait rester une activité humaine.. mais je me trompe. Je pense qu’il ne faut pas alimenter des IA avec des manuscrits confidentiels non évalués… mais je me trompe. Je […]

L’IA pour vérifier la pertinence des références dans un manuscrit J’ai découvert ce communiqué de presse de Springer Nature du 7 avril 2025 avec pour titre : ‘New research integrity AI tool added to Springer Nature’s growing portfolio‘. Je traduis des extraits (merci DeepL) : Un nouvel outil d’IA permettant d’identifier les références non pertinentes […]

Le dernier numéro de la revue de l’Afis vient de sortir en kiosque (numéro 352, 144 pages). Il est dense, plein d’articles dans divers domaines. Le dossier de presse contient le sommaire et quelques informations. « Science officielle », « science réglementaire » : comment discréditer la science au nom de la science C’est le titre de l’éditorial qui se […]

Nous avons l’habitude de commenter tous ces embellissements dans les articles, et autres tortures des données. Ce sont des pratiques fréquentes. Cet article du JAMA Network Open (4 mars 2025) n’est pas sur la recherche ou les publications mais sur les pratiques chirurgicales…. Faut-il en rire comme nous le faisons sur des pratiques d’auteurs douteuses […]

Hier, j’ai résumé quelques présentations de la première journée de FAIRS à Oxford. Voici des présentations de la journée du 8 avril : Des fraudeurs ne sont jamais poursuivis Patricia Murray a présenté ‘Misuse of generative therapies‘ en détaillant les fraudes avec les greffes de trachée, dont le cas de Paolo Macchiarini, ainsi que d’autres […]

J’ai présenté le 10 mars 2025 la conférence FAIRS dont le programme est ici. Ce sont trois jours de meeting à Oxford, organisés par Dorothy Bishop. Il y a 90 inscrits sur place et 120 online. En tant qu’inscrit, j’ai eu la liste des participants et dommage, pas de français, sauf G Cabanac orateur. Il […]

Cette news de Nature du 28 mars 2025 revient sur un sujet débattu en permanence sans bonnes données objectives. Cette news se base sur deux publications de 2025. La base : est-ce qu’un chercheur peut accepter de travailler sans compensation ? Est-ce que la réponse est influencée par le statut commercial ou sans but lucratif […]

Cela devait arriver ! Pendant un temps, comme d’autres, j’ai pensé que confier une évaluation d’un manuscrit à une IA n’était pas conseillé. Les arguments étaient : il faut l’autorisation de l’auteur correspondant ; télécharger un manuscrit non évalué était dangereux car ce manuscrit pouvait alimenter la base de l’IA. Faîtes le peer review de […]

Le 28 mars, à la Bibliothèque nationale de France, Paris 13, une journée a été organisée la journée ‘Sciences et médias‘. Il y avait 8 partenaires : l’Association des Journalistes Scientifiques de la Presse d’Information (AJSPI), la Bibliothèque nationale de France (BnF), la Société Chimique de France (SCF), la Société Française de Physique (SFP), la Société Française de Statistique (SFdS), la Société Informatique de France (SIF), la Société […]

J’utilise parfois les Intelligence Artificielles génératives (IAg) pour écrire des documents, et je mets toujours une note en bas de page expliquant quel outil j’ai utilisé avec la date. Mais quelles IAg utiliser ? Il en existe beaucoup, même si l’une domine. J’ai cité des outils dans un précédent billet, et je remarque qu’il y […]

C’est une nouvelle ligne directrice de COPE (Committee On Publication Ethics) publiée en février 2025, avec pour titre : AUTHOR FEES AND WAIVERS. How to disclose, apply, and administer author fees and waivers, discounts, or incentives. Les points clés Les préoccupations relatives aux frais de traitement des articles (FTA) concernent principalement les conflits potentiels entre […]

C’est un bon article, avec beaucoup de données et d’illustrations. Mis en ligne en janvier 2025 par la revue ‘Technology in society‘ (accès libre). Les auteurs sont danois et hollandais. Il y a eu plus de 2 500 réponses (Danemark). Merci à TheMetaNews qui a signalé cet article. Le résultat principal est l’identification de trois […]

Cet article du Lancet Digital Health d’avril 2025 est un point de vue détaillée et sage sur une question difficile et controversée. Encore plus complexe quand l’Intelligence Artificielle (IA) arrive dans ce contexte. Il y a 8 auteurs affiliés à des institutions en Allemagne, au Canada, en Suisse et aux USA. Des biais liés à […]

Ce billet sur Scholarly Kitchen du 20 mars 2025 est très complet, très détaillé. Normal, il est écrit par Phill Jones, co-fondateur de MoreBrains Cooperative. Ce billet contient les meilleures références sur le sujet, avec quelques commentaires. Son titre : Tackling Science’s ‘Nasty Photoshop Problem’ Embellissements d’images avec des outils Photoshop like L’auteur rappelle quelques […]

C’est vertigineux car de nouvelles revues sont créées alors que les chercheurs ont déjà beaucoup trop de revues à leur disposition. Est-ce une réponse aux universités qui poussent les chercheurs à publier beaucoup plus ? Périodiquement, je publie des billets sur de nouveaux projets..   Par exemple, un nouveau Lancet arrive encore, et ce sera un […]

Développer l’esprit critique dans toutes les populations et toutes les classes d’âge est une urgence dans ce monde où mésinformation et désinformation sont le premier risque mondial, avant les risques liés au climat, aux conflits, etc… Les REC (Rencontres de l’Esprit Critique) proposent de se questionner sur de nombreux sujets (sciences, philosophie, santé, histoire, technologie…), […]

Utiliser les Intelligences Artificielles génératives (IAg) nécessite une vigilance majeure…  Nous aurons des surprises. Nous savons qu’il est fortement déconseillé de déposer des manuscrits pour une aide au peer-review. Ces manuscrits n’ont pas été évalués et ils vont alimenter la mémoire de ces IAg. De plus, une autorisation de l’auteur serait nécessaire. Malgré les recommandations, […]

Puis-je me permettre de donner mon opinion, quitte à voir encore arriver la meute des complotistes !!!  Je veux bien discuter, mais avec des faits plutôt que sur des fake news. Je présente des faits. Soumission le 20 mars 2020 de l’article faisant croire que l’hydroxychloroquine était utile dans la COVID-19 Cet article a été […]

Cet article analyse l’impact des scandales scientifiques dans un pays, le Danemark. L’auteur a considéré quelques cas, dont un cas au Danemark, et évoqué quelques cas comme Wakefield (Angleterre), Stapel (Hollande) et Marcchiarini (Suède). C’est un article de 22 pages (octobre 2024) dans la revue ‘Journal of Responsible Innovation’. Immédiatement, nous vient à l’esprit une […]

Vendredi dernier, nous avons évoqué le Colloque Intégrité scientifique à l’aune du droit. Deuxième matinée consacrée aux perspectives Intervention de Stéphanie Ruphy, directrice de l’OFIS, qui a présenté les activités en matière d’Intégrité Scientifique (IS). Des données sur la situation en France concernant les volumes de cas traités vont être bientôt publiées par l’OFIS. Elles […]

  Intervention de Stéphanie Rufy, directrice de l’OFIS, a présenté les activités en matière d’IS. Des données sur la situation en France concernant les volumes de cas traités vont être bientôt publiées par l’OFIS. Toutes les missions et activités sont sur le site. Le prochain colloque sera sur IA générative et intégrité scientifique.   Anne-Paule […]

J’ai présenté le programme de ce colloque qui a commencé jeudi 13 mars avec deux sessions sur les premiers bilans de l’intégrité scientifique (IS). Le premier colloque date de 2019. Quelques appartés sur la situation américaine de l’ère Trump II. Le regard institutionnel Plusieurs présentations complémentaires qui ont bien montré les avancées dans le domaine […]

Les NPIs (non pharmaceutical interventions) sont un concept bien défini, mais est-ce que l’appellation ‘négative’ doit être changée ? La NPIS (non-pharmaceutical intervention society) est une jeune société savante créée à l’Université de Montpelleir sous l’égide du Pr Gregory Ninot. Un travail formidable a été fait. Une INM (intervention non médicamenteuse) est une Méthode de […]

La métascience, ou recherche sur la recherche, se développe rapidement depuis le début des années 2000. Elle se développe bien en Europe, notamment grâce à des ressources d’agences de recherche locales et/ou européennes. Pour Wikipedia, c’est l’utilisation de méthodes scientifiques pour évaluer la science. Oxford, parmi les villes ayant beaucoup développé la métascience Rendons hommages […]

C’est un message qui ne plait pas à certains mâles aux cheveux blancs, mais il existe pas mal de données concordantes. Cet article dans The Conversation le 5 mars 2025, par des auteurs français fiables, permet de vulgariser les résultats d’une belle étude publiée dans QSS. The Conversation : Les auteurs résument les données les […]

Autre information étonnante et peu acceptable, relayée par le HuffPost le 28 février 2025 avec le titre : Comment imaginer que l’on puisse interdire à un chercheur de co-signer un article ? Voici ce qui est rapporté : « Le personnel des CDC ne doit pas être coauteur de manuscrits ou de résumés avec le […]

Il est trop tôt pour se rendre compte de la situation américaine et de ses impacts internationaux sur la santé et l’information. Je n’arrive pas à suivre car il y a trop d’informations. Je choisis deux thèmes. Quelle fiabilité de PubMed ? Les algorithmes changent-ils ? Cette base de données américaine avec 37 millions d’articles […]

J’ai déjà évoqué le soutien que nous devons apporter aux initiatives pour promouvoir le Nutri Score, et la partie n’est pas gagnée. C’est une illustration du combat entre données probantes, protection de la santé et enjeux économiques. L’équipe qui développe le Nutri-Score fait un travail remarquable et le blog dédié apporte régulièrement des actualités. Renoncement […]

Point n’est besoin d’expliquer ce qui se passe aux USA depuis l’arrivée au pouvoir de Donald Trump dans le domaine de la recherche et de la santé. Des organisations sont démantelées, des fonctionnaires licenciés, des aides humanitaires internationales bloquées… quitte à laisser pourrir de la nourriture.. Le silence n’est pas une option pour la communauté […]

Ce livre, publié par FIRST éditions, est bienvenu pour alerter les citoyens sur ce qui est caché, à savoir les risques médicamenteux. En 240 pages, des arguments avec citation des sources, c’est facile à lire. Un message important pour la santé publique, malheureusement ignoré Rien de neuf depuis Molière, Le Malade imaginaire, 1673, cité en […]

Il faut se réjouir lorsque des moyens (ici $ 25 000 par an pendant 4 ans) sont mis à disposition pour créer des revues en langue française. Tous les détails de cet appel à projet sont sur le site du Fonds de Recherche du Québec (FRQ), et il faut répondre avant le 18 juin 2025. […]

Les rétractations d’articles de l’IHU Méditerranée Infection continuent et ne sont pas finies. C’est un travail énorme pour les revues qui sont régulièrement alertées et qui sont confrontées à des auteurs qui se défendent et ne veulent pas reconnaître les pratiques douteuses et fraudes ! Il est possible que des menaces auprès des revues soient […]

Félicitons le CNOM (Conseil national de l’ordre des médecins) pour ses actions dans le domaine de la communication des médecins, et pour ses informations sur l’IA (Intelligence artificielle). Tout va vite, et il faut ‘monter dans le train’. C’est l’Académie nationale de médecine qui avait alerté dans son rapport de mars 2024 sur l’IA générative. […]

C’est un billet de RW du 17 février 2025 qui nous informe des rétractations 2024 de Springer Nature. Il fallait trouver cette information. BRAVO pour la transparence chez Springer Nature…   attendons les autres éditeurs, car rétracter est un indicateur vertueux d’un éditeur. 2 923 rétractations en 2024 pour un seul éditeur : tout monte ! […]

La pression monte aux Etats-Unis depuis la prise en main de l’administration Trump dans tous les domaines, y compris la science. Je croise fréquemment des collègues ayant des commentaires sur la chasse aux sorcières en Amérique du Nord. Des articles supprimés des sites des journaux scientifiques Voici un exemple précis et une résistance de l’auteur. […]