RETRACTATION Le billet du 7 août 2023 commentait un article ayant montré les dérives éthiques de l’équipe de l’IHU de Marseille. Il avait pour titre : On nous fait croire que l’intégrité se développe en France : pourquoi le plus grand fraudeur du monde est-il protégé ? Mes propos sur la Conférence nationale des comités […]

Un éditorial a été publié simultanément par plus de 100 journaux scientifiques en août 2023. En accès libre, il a été signé par les rédacteurs de revues prestigieuses, BMJ, Lancet, NEJM, JAMA et autres… Son titre : Reducing the risks of nuclear war — The role of health professionals. Il m’a fait prendre conscience de […]

C’est un billet du blog ASPAbio qui apporte des conseils pour mieux diffuser vos posters. En déposant votre poster sous forme de preprint, cela permet de le diffuser avant un congrès, de le citer dans des dossiers, etc… Preprint : un nouvel intérêt pour les posters ? Le billet explique qu’en déposant votre poster preprint, […]

La revue systématique (RS) est en vogue ! En fait, c’est une recherche dont on contrôle les délais et les financements : pratique ! Le volume des revues systématique augmente et beaucoup sont très mauvaises. Parfois ce sont des thèses d’exercices confiées à un étudiant qui fait ce qu’il peut sans être encadré.. La bonne […]

Cherchez l’erreur : Nutrients est une revue du groupe mercantile MDPI (zone grise des revues de faible qualité). Nutrients a un passé sulfureux car 10 membres du comité de rédaction ont démissionné brutalement en 2018…  ils n’acceptaient pas assez d’articles… Des éditeurs mercantiles n’ont pas été inclus dans la liste des revues présumées non prédatrices […]

C’est un billet du 17 septembre 2023 sur Scholarly Kitchen qui commence ainsi : Until recently, MDPI and Frontiers were known for their meteoric rise. At one point, powered by the Guest Editor model, the two publishers combined for about 500,000 papers (annualized), which translated into nearly USD $1,000,000,000 annual revenue. Their growth was extraordinary, […]

News dans Nature le 16 août 2023 : Thousands of scientists are cutting back on Twitter, seeding angst and uncertainty. A Nature survey reveals scientists’ reasons for leaving the social-media platform now known as X, and what they are doing to build and maintain a sense of community. La moitié des chercheurs ont diminué les […]

Un challenge pour les revues scientifiques et pour tous les chercheurs est de ne pas se tromper entre les articles écrits par des humains et pas ChatGPT. Il existe des outils pour faire la différence, et cet article de Cell Reports Physical Science (juin 2023) est bien fait. Son titre : Distinguishing academic science writing […]

Hier, nous avons brièvement rapporté quelques commentaires sur un bon livre…  avec la saga de la corruption généralisée de fonctionnaires FDA, de médecins prescripteurs, de journaux complices, etc. Cette corruption était organisée par des industries pharmaceutiques. La famille Sackler possédant Purdue, a toujours réussi à faire suspecter des employés qui se sont retrouvés face aux […]

C’est assez vite que j’ai lu cet ouvrage broché de près de 700 pages sur la famille Sackler, propriétaires de PurduePharma. Je l’avais acheté puis mis de côté…  mais la lecture se fait comme un polar (un peu compliqué parfois car il y a beaucoup de personnes). Depuis ce mois de septembre, il est en […]

C’est une opinion simple en deux pages dans le British Journal of Medicine, le 17 août 2023. C’est la synthèse d’une présentation de mai 2023 par Ivan Oransky à l’université de Stanford. Combien vaut une citation ? Trois, six ou 100 000 US $ ? Les trois chiffres sont faux, mais tout dépend de l’évaluateur. […]

L’IRAFPA (Institut de Recherche et d’Action sur la Fraude et le Plagiat Scientifique ) organise des petits congrès où les échanges sont très fructueux. Le livre ‘Les nouvelles frontières de l’intégrité scientifique’ reprend onze communications du colloque de Coïmbra en juin 2022. Le programme complet de ce colloque est ici. Le premier colloque avait donné […]

Le JAMA Network Open a publié mi-août 2023 un article sur les dangers des messages de médecins américains sur les réseaux sociaux. Encore la COVID-19 ! Article passionnant et inquiétant. Le titre : Communication of COVID-19 Misinformation on Social Media by Physicians in the US Les médecins contribuent à la désinformation (USA) Voici les résultats […]

Nos collègues français se montrent à l’international pour faire la promotion de l’intégrité. C’est une excellente initiative.. pour être écouté dans leur pays d’origine. Après Chérifa Boukacem-Zeghmouri hier dans Nature, félicitons Rapahël Lévy pour ses recherches. Il s’agit d’une interview dans Nature reviews physics en août 2023, journal créé en 2019 avec un facteur d’impact […]

Quelle joie de découvrir un éditorial dans Nature (17 août 2023) signé par une collègue professeure en sciences de l’information et de la communication (Lyon 1). Lors de la mise en ligne le 15 août, le titre était : Predatory journals entrap unsuspecting scientists. Here’s how universities can support researchers. Training from institutions on publishing […]

Cet été, David Larousserie, Sandrine Cabut et Hervé Morin ont publié une série d’articles sur les chasseurs de fraudes. Parmi ces portraits, félicitons Clara Locher (Rennes) et Guillaume Cabanac (Toulouse). Les portraits sont réussis. Ils se connaissent entre eux et certains ont des blogs très riches d’informations. Voici ces chasseurs qui sont tous actifs : […]

Excellent article dans PeerJ en août 2023 avec le titre « The experiences of COVID-19 preprint authors: a survey of researchers about publishing and receiving feedback on their work during the pandemic ». Il y a beaucoup d’analyses car il y avait 36 questions. Ils ont inclu les auteurs correspondants de 12,230 COVID-19 preprints : 12% des […]

Dans le billet du 7 août 2023, j’ai repris les données d’un article de Research Integrity and Peer Review montrant les dérives éthiques de l’IHU de Marseille. Ces dérives ont commencé bien avant la pandémie à SARS-CoV-2 et elles étaient connues mais non dénoncées. Parmi les observations de cet article ‘le même numéro d’autorisation d’un […]

La revue Critical Care Medicine a été impactée par les fraudes de J Boldt. Ce chercheur allemand a probablement causé la mort de patients suite aux fraudes détectées dans ses articles. Nous avons souvent évoqué ces fraudes, dans le domaine de l’utilisation de solutés intraveineux pour augmenter le volume vasculaire. Boldt avec 194 rétractations est […]

Comme certains de mes collègues, je sais ce que sont des données probantes, mais pour les définir, je ne me suis jamais posé la question. En biomédecine, nous avons été éduqués avec les concepts de niveau de preuve et de données factuelles… Il est sous-entendu parfois que seul l’essai randomisé contrôlé est une méthode permettant […]

C’est ENRIO qui vient de publier un guide de 60 pages sur la protection des lanceurs d’alerte. ENRIO est le réseau européen des organismes d’intégrité scientifique. ENRIO a plus de 20 membres dont quatre en France (Cirad, Cnrs, Inserm et Ofis). Le prochain congrès de ENRIO est en France les 7 et 8 septembre 2023. […]

Les facteurs d’impact (FI) ont été publiés par Clarivate fin juin comme chaque année. Très utiles pour les analyses bibliométriques, mais quel business pour les naïfs. Déception pour les aficionados du comptage des haricots, car il n’y a plus qu’une décimale…  donc beaucoup d’ex aequos ! Ce ne sera plus possible de dire qu’un journal […]

Cet article détaille les 248 études publiées par l’IHU de Marseille avec le même numéro d’autorisation d’un comité de protection des personnes. Félicitons en particulier les auteurs, car c’est un énorme travail. Les cocoricos Félicitons la revue RIPR, et son rédacteur en chef Mario Malicki, qui dénoncent ce scandale en acceptant l’article. Le titre de […]

Ce point de vue publié dans le JAMA Internal Medicine de fin juillet 2023 est-il un coup d’épée dans l’eau ? Nous ne sommes pas tous au fait des nouveaux traitements, mais lire ces deux pages ne surprend pas. Aux Etats-Unis, la mise sur le marché des médicaments est une décision conjointe des politiques (représentants […]

La vie de l’éditeur Hindawi a toujours été hectique. Créé en 1997 au Caire par Ahmed Hindawi, cet éditeur est devenu totalement Open Access avec des frais de traitements des articles (APCs) pas très élevés. Considéré comme éditeur prédateur dans les années 2010, Hindawi a déménagé à Londres et engagé des personnels compétents. Hindawi a […]

En 2019, j’ai été impressionné par la conférence plénière d’Alan Finkel lors du congrès mondial de l’intégrité scientifique à Hong Kong, sans diapos mais passionnant. L’anglais est facilement compris et de nombreuses données exposées lors de cette conférence sur l’état catastrophique de la recherche… la mauvaise reproductibilité, les rétractations, etc… Je l’ai ré-écoutée avec plaisir. […]

Des rumeurs ont circulé sur des articles scientifiques co-signés par le Pr Marc Tessier-Lavigne qui a une excellente carrière. Il est devenu président de l’université de Stanford en 2016. L’histoire est longue et complexe avec de très nombreuses alertes auxquelles Marc Tessier-Lavigne et ses avocats ont répondu. Les accusations concernent des articles dont l’un dans […]

C’est un article de juillet 2023 dans Journal of Pain. Cet article est un miroir de l’article d’hier qui expliquait que 25 % des essais cliniques sont des zombies. Les méthodes sont bien décrites, et c’est une recherche complexe. Le protocole a été enregistré. Les auteurs ont identifié huit essais cliniques que l’on peut qualifier […]

Les articles de Richard van Noorden dans Nature sont toujours documentées et informatifs. Le 18 juillet, il a présenté une vision de la très mauvaise qualité des essais cliniques publiés dans les revues  scientifiques… Article d’accès libre facile à lire. John Carlisle a été précurseur Il a repris en détail les observations de J Carlisle, […]

L’observation de la tournure prise par le système des publications est effrayante : des incitations au publish or perish qui perdurent ; des compétitions entre les revues qui deviennent malsaines ; des sociétés savantes débordées par des groupes mercantiles, sociétés qui ne contrôlent plus la diffusion des savoirs ; et surtout des coûts inadmissibles pour […]

Comme le groupe MDPI, le groupe mercantile Frontiers a des pratiques surprenantes. Un éditorial soumis le 29 mai, accepté le 9 juin a été publié le 22 juin 2023.. déjà un peu rapide. Le titre : Editorial: Community series – characterization of mobile genetic elements associated with acquired resistance mechanisms, volume II Les co-auteurs ne […]

ChatGPT, IA qu’en penser ? Ce numéro 345 commence par un dossier IA / ChatGPT. Ce sont de nouvelles technologies dont il faudra évaluer les risques et les bénéfices. Bon dossier, y compris les questions juridiques. Est-ce que les risques de désinformation vont augmenter ? C’est un appel au développement de l’esprit critique. Dossier sur […]

C’est un article de PLOS Bilogy en juillet 2023 publié par des auteurs américains, anglais, australiens, allemands, espagnols et népalais. Il y a beaucoup de données illustrant les difficultés des chercheurs non anglophones pour rentrer dans le jeu. 908 participants de 8 nationalités L’article a une image que j’ai reprise pour exprimer les principaux messages. […]

Il s’agit d’un avis du 23 juin 2023 (non daté dans le PDF) qui est intéressant, bien construit sur un sujet difficile. Je cite des extraits, tout en vous suggérant de lire tranquillement l’avis complet de 27 pages. Au minimum, lisez le résumé. Il y a beaucoup de bonne suggestions. Rappelons le constat : le […]

Cet article de JAMA Open suggère que la plupart des études cliniques publiées en tant que preprints sur medRxiv et publiées par la suite dans des revues à comité de lecture avaient des caractéristiques d’étude, des résultats et des interprétations finales plutôt concordants. C’est rassurant. Ces études portent sur des articles publiés après mise en […]

Je ne peux pas suivre tant les initiatives sont foisonnantes dans le domaine de la recherche. Des outils pour chercheurs arrivent et d’autres disparaissent. Certains sont pérennes et s’installent dans la recherche. L’intelligence artificielle (IA) va changer rapidement nos habitudes Les plus-in obligatoires Ce sont parfois de plug-ins a ajouter à son ordinateur, ou des […]

Frais de publication : « Nous sommes au bord du gouffre » est le titre d’un billet de blog du Cnrs fin juin 2023. Je ne suis pas convaincu que des mesures seront prises…   et il n’y a qu’à faire un pas en avant. Il s’agit d’une interview d’Alain Schuhl, directeur général délégué à la science au […]

Cet article a été publié le 4 juillet 2023 dans SEE (Science and Engineering Ethics). Les auteurs sont chinois et hollandais (équipe de Lex Bouter). 26 % des notices de rétractation mentionnent une enquête institutionnelle J’ai traduit le résumé : Les publications des revues universitaires peuvent être rétractées à la suite d’enquêtes institutionnelles confirmant des […]

En bref : la qualité des données est une problématique des revues ; identifier les coupables est une problématique des institutions. Il s’agit d’un domaine qui dysfonctionne : les journaux se plaignent des institutions qui ne répondent pas aux demandes d’investigation sur des données d’un manuscrit en cours d’évaluation, voire après publication. Inversement, les institutions […]

Le BMJ a publié le 20 juin 2023 une analyse sur la mauvaise visibilité des rétractations nous appelle à une réaction. Cela fait plus de 20 ans que ce problème est décrit. L’article intitulé ‘Poor visibility of retracted articles : a problem that should no longer be ignored’ a un sous-titre que je traduis : « Christophe Boudry […]

Je n’aurai pas acheté ce livre s’il ne m’avait pas été offert, et c’est une erreur. J’ai eu beaucoup de plaisir à lire ce livre sur la bioéthique, et j’ai beaucoup appris. Il est facile à lire car bien conçu. L’objectif du livre est de proposer un état des lieux après 40 ans de fonctionnement […]

C’est une note dans Nature (2 décembre 2022) qui m’a fait découvrir un article de collègues de l’Institut Pasteur. Le titre Men dominate conference Q&A sessions — including online ones est plus informatif que le titre du preprint (déposé le 17 octobre) analysé Gender-based disparities and biases in science: an observational study of a virtual […]

C’est une scoping review publiée par eLife en juin 2023, et faite sous l’égide des équipes canadiennes de David Moher. Le champ de cette recherche est limité à deux années (2018 et 2019). Comparés aux plus de 3 millions d’articles publiés pendant ces deux années, l’attention portée à la reproductibilité est faible. La course à […]

Le débat sur l’origine de la COVID-19, co-organisé par Sorbonne Université et le Théâtre de la ville vient d’être mis en ligne. Un accident de laboratoire ? Ce débat montre comment petit à petit, les éléments en défaveur d’une origine zoonotique et ceux en faveurs d’un accident lié à la recherche font pencher la balance […]

Le sujet science ouverte et intégrité de la recherche est fréquemment discuté, et il y a des séminaires sur ce thème important. Bien sûr que la science ouverte est une avancée et est très utile pour une meilleure intégrité scientifique. Je suis parfois gêné par la petite musique qui laisse entendre qu’avec la science ouverte, […]

La presse grand public, Le Monde en tête, a commenté la publication d’un preprint scandaleux de l’équipe de l’IHU de Marseille. Félicitons la SFPT (Société Française de Pharmacologie et de Thérapeutique) pour avoir fédéré 16 sociétés savantes pour signer une tribune dans Le Monde du 28 mai 2023 intitulée (version en ligne) : « Recherche clinique […]

Ce site internet a classé, analysé les 489 rétractations en Australie et les 68 rétractations en Nouvelle-Zélande (en juin 2023). La source est RetractionWatch.  Le site s’appelle Retractions Australia et tout est simple à consulter. Il y a la liste des articles et les top 10 des journaux, institutions, auteurs, etc. et quelques autres analyses. […]

Voici la traduction du résumé d’un preprint déposé sur arXiv le 11 juin 2023 avec le titre Characterizing the effect of retractions on scientific careers. C’est un gros travail avec 38 pages, 7 figures, 13 tableaux. Complexe quand ce sont des maths. Les trois auteurs signent ‘Social Science Division, New York University Abu Dhabi’. Ils […]

Ces journaux de faible qualité, avec un peer review de complaisance, avec des publications d’articles dont les reviewers ont demandé le rejet, etc.  publient plein de trucs troublants. Des collègues soutiennent ces journaux de faible qualité, et heureusement la Conférence des doyens de médecine a éliminé MDPI et Frontiers de la liste blanche des 3400 […]