Les cas d’intégrité demandent des investigations et trop souvent, des bruits circulent, des accusations rapides, etc… et ces cas demandent une sérénité et une confidentialité totale pendant les investigations. Il y a plusieurs personnes à protéger : les lanceurs d’alerte et ceux qu’ils accusent. Je reprends brièvement deux articles anciens dans de bonnes revues : […]

Nous avons de la compassion pour ce pays en guerre et il existe des initiatives en science pour aider les chercheurs ukrainiens, et rejeter ou aider les chercheurs russes. Une initiative permet de supporter les revues scientifiques ukrainiennes. Il y a environ 1000 revues scientifiques en Ukraine, dont 700 en accès libre, et des maisons […]

L’Association Claude Bernard, St Julien en Beaujolais, m’a invité le 18 mars 2022 pour présenter une conférence sur les fake news et le complotisme. J’ai résumé la conférence dans une vidéo de 30 minutes qui reprend 7 points (voir image). Parmi la douzaine de livres que j’ai sur le sujet, je recommande deux documents qui […]

Attention : ne pas généraliser sans plus d’informations, mais le problème existe ! Je n’avais pas encore eu le temps de lire ce livre mais quand je l’ai ouvert, je ne l’ai plus quitté, comme un polar !! Bien écrit, c’est la description détaillée du parcours de quelques doctorants sur de longues périodes (plusieurs années), […]

Ce sont d’excellentes ressources proposées par l’INIST. C’est bien fait. Je n’ai pas suivi le cours (20 h), mais j’ai regardé les 9 pdf des cours. Ces 9 pdf sont longs, documentés avec beaucoup de liens. EXCELLENT !! Par exemple, le pdf pour le peer review ouvert (15 pages) est utile. Je reprends les objectifs […]

Le rapport 2021 vient d’être publié en avril 2022 (21 pages) et vous pourrez le télécharger sur le site du ministère. Il n’y a pas de révélations fantastiques, voire crapuleuses sur les comportements des chercheurs. La recherche responsable a 3 piliers et les distinctions sont parfois difficiles : déontologie, éthique et intégrité. Il y a […]

Nous avons peu d’abonnements à des revues, mais je suis fidèle depuis longtemps à une revue ancienne et de qualité que j’aime lire. Annals of Improbable Research a 6 numéros pas an (envoi d’un pdf, après l’abandon du papier en 2015) pour 25 $. Cette revue d’environ 35 pages est sous l’égide de Marc Abrahams, […]

C’est un livre de qualité qui doit trouver ses lecteurs : professionnels de santé et citoyens avertis. Ce livre se veut l’encyclopédie de qualité sur la COVID-19. Tout professionnel de santé qui veut un livre documenté sera satisfait, pas drôle (normal) mais de qualité (bravo). L’auteur, rédacteur de la revue Médecine est un défenseur de […]

Je suis toujours frappé par les politiques différentes des revues selon les disciplines. C’est normal, mais c’est souvent un grand écart entre des articles de biologie fondamentale, de physique, de médecine et de sciences humaines et sociales. Chaque style de rédaction correspond à des cultures, des états d’esprit.. mais ce sont tous des styles adaptés […]

J’ai évoqué un problème connu en Chine, avec la prise d’organes de prisonniers pour les transplantations. Les revues scientifiques ne devraient pas accepter des publications non éthiques. Les équipes chinoises ont une expérience des transplantations et ce phénomène est connu des transplanteurs. C’est la première fois que je découvre un article fait à partir d’articles […]

Ce bon rapport d’avril 2022 est en accès libre sur le site IAP. Il y a un rapport de synthèse traduit en français (27 pages), chinois, arabe, espagnol, portugais, et russe. Nous savions que l’IAP (InterAcademy Partnership qui regroupe 140 académies des sciences) travaillait sur ce thème. Comme certains d’entre vous, j’avais répondu à leur […]

L’outil peut paraître compliqué mais il est vraiment bienvenu pour qualifier les auteurs des publications d’essais cliniques. Pour ceux qui ne sont pas familiers, lister les auteurs d’un essai clinique est une chasse au trésor avec de nombreux chasseurs. Il existe encore des manuscrits d’essais cliniques pour lesquels les auteurs sont une foire d’empoigne à […]

C’est une suggestion vertueuse du CNRS, mais est-ce réaliste ? Les chercheurs doivent-ils abandonner Nature et de nombreuses revues prestigieuses ?  Que penser de cette proposition d’avril 2022 ? APC (Article Processing Charge) ou FTA (Frais de Traitement des Articles). Voici le chapeau de l’interview de A Schuhl : Dans le cadre de la politique […]

Depuis environ 40 ans, c’est un questionnement qui revient périodiquement, et rien ne se passe. Lorsque nous soumettons un manuscrit, il faut se plier à des exigences nombreuses pour mettre les références en forme. Les habitudes varient entre les disciplines. Par exemple, dans certains domaines des sciences sociales, ce sont des notes en bas de […]

Cet article a comparé les articles en ligne de quatre quotidiens grand public concernant l’utilisation de l’hydroxychloroquine dans la COVID-19. La recherche a été faite avec les termes chloroquine, hydroxychloroquine, plaquenil et raoult du 1 février 2020 au 13 juin 2020. Ce sont 142 articles pour lemonde.fr, 185 pour lefigaro.fr, 67 pour letemps.ch, et 64 […]

Nous avons présenté le numéro 339 de Science et Pseudo-Sciences qui contenait la première partie du dossier sur la transition énergétique. Dans le numéro d’avril à juin 2022, la seconde partie de ce dossier Transition énergétique commence par une introduction déprimante. Les figures de la page 5 montrent l’évolution des sources d’énergie primaire depuis 1965. […]

Avertissement : La plupart de mes collègues marseillais sont de bons professionnels, mais… Je voudrais simplement attirer l’attention sur un dysfonctionnement du système des publications à propos d’un article dans la revue ‘Journal of Market Access & Health Policy’ qui a un taux d’acceptation de 88 % des articles soumis. L’article ‘Commentary on “Hydroxychloroquine and […]

Il a fallu un peu de temps depuis le départ de Harold Bauchner pour nommer une femme à cette position prestigieuse de rédacteur en chef du JAMA. H Bauchner est parti fin juin 2021, et mon billet se terminait par cette phrase : Est-ce que le prochain rédacteur en chef du JAMA sera noir ? […]

Cet éditorial de Nature du 6 avril 2022 est bienvenu (Time to recognize authorship of open data), bien qu’il semble ignorer que ce concept d’auteurs de données ait été formalisé dès 2017 dans le NEJM. Le titre était : Data Authorship as an Incentive to Data Sharing. Cet éditorial émet l’hypothèse raisonnable qui dit que […]

J’ai besoin de vos lumières sur le premier paragraphe (traduit en français) d’une lettre à l’éditeur parue dans la prestigieuses revue Nature en février 2022. Le titre : How bullying becomes a career tool. Bullying : intimidation, harcèlement, brimades,.. Qu’en pensez-vous ? Est-ce que les auteurs nous trompent ? Parmi les scandales récents les plus […]

Chaque année, sous un format assez standard, toutes les revues du groupe JAMA publient des données sur les fonctionnements des revues l’année précédente. C’est instructif et cela permet de comparer les revues entre elles et de voir quelles sont les variables mesurées. Les tableaux sont presque identiques entre les revues, et un éditorial du rédacteur […]

Nous avons tous été admiratifs devant des posters de congrès encyclopédiques : même en 15 minutes, les principaux messages ne sont pas compris. En discutant lors de formation sur les abstracts et posters, les participants suivent des hypothèses que je propose. Je fais l’hypothèse que les posters exposés dans de grands halls de congrès auront […]

Cette supposition est basée sur des analyses de deux revues américaines, JAMA et NEJM sur 30 ans. Cet article de mars 2022 est intitulé ‘The Under-representation and Stagnation of Female, Black, and Hispanic Authorship in the Journal of the American Medical Association and the New England Journal of Medicine‘. Il a été publié dans Journal […]

Je suis bien d’accord avec cette perspective publiée dans PLOS Biology  début mars 2022 : Correction of scientific literature: Too little, too late!. Les auteurs (L Besançon, E Bik, J Heathers, G Meyerowitz-Katz) proposent 8 idées pour améliorer la situation. Ce sont de bonnes suggestions, mais qui les mettra en oeuvre.. ne désespérons pas. Ces […]

Les notions de reproductibilité des recherches sont difficiles à définir simplement, et il existe une énorme littérature sur ces concepts. La non-reproductibilité s’explique en partie par des méconduites, et donc le non respect des principes d’intégrité scientifique. En un peu plus de 2 pages, deux chercheurs allemands ont essayé d’expliquer cela simplement, et ils y […]

Ce billet est en miroir de celui d’hier sur la non-efficacité de l’ ivermectine dans la COVID-19. Il s’agit d’un article brésilien dans une revue presque prestigieuse, Lancet Regional Health – Americas. Comme hier, c’est un essai randomisé double aveugle comparant l’HCQ (hydroxychloroquine) à un placebo, avec près de 700 malades par groupe. C’est aussi […]

Le 30 mars 2022, le New England Journal of Medicine a publié un essai randomisé, double aveugle, versus placebo pour évaluer l’intérêt de l’ivermectine dans la COVID-19 pour prévenir les hospitalisations. Essai fait au Brésil avec 3515 malades dont 679 ont eu ivermectine et 679 placebo, et d’autres interventions. Inclusion : Patients who had had […]

Dans le cadre d’un projet européen (EnTIRE), des chercheurs ont voulu analyser les cas de méconduites discutés dans la littérature scientifique. Il s’agit d’une scoping review (étude de portée) publiée en avril 2021 dans RIPR : ‘A scoping review of the literature featuring research ethics and research integrity cases’. L’étude est bien faite, avec la […]

C’est RetractionWatch qui nous a appris qu’un article d’auteurs français avait été rétracté à la demande des auteurs. Je ne comprends pas le motif de la rétractation, car un erratum était probablement suffisant. J’aurai besoin d’informations pour être certain, car la vraie cause de la rétraction (par exemple règlement de compte) est peut-être cachée. On […]

C’est en lisant le blog de Leonid Schneider (billet du 23 mars 2022) que j’ai vu cette pétition que j’ai signée. Je sais que les pétitions ne sont pas toujours utiles. Il est rare que j’utilise ce blog pour une pétition, mais la situation en Ukraine n’est pas tenable.Nous avons vu les revues qui hésitent […]

Nous avons vu la plupart des biais des essais en général. La littérature est importante, avec par exemple environ 40 publications montrant que pour au moins 50 % des critères de jugement, il y a des différences entre protocoles et publications. Les langages embellissent les résultats. Le seuil de 0,05 est une convention délétère pour […]

Je ne connaissais pas cette notion, et cet article du 18 mars 2022 (JAMA Open Network) m’a intéressé. Son titre : ‘The Fragility of Statistically Significant Results in Randomized Clinical Trials for COVID-19‘. Je ne sais pas quelle est la valeur de ce concept de fragilité des résultats significatifs qui paraît simple. Il est bien […]

Quand je fais des cours, je surprends souvent en expliquant que pour faire un résumé fidèle à l’article, le plus simple est de copier / coller des phrases de l’article. Mais des auteurs écrivent des résumés sans relire leur manuscrit, voire en paraphrasant leur manuscrit. In fine, ils sont tentés d’embellir les résumés. Il existe […]

C’est un travail énorme fait par une équipe hollandaise et publié le 18 février 2022 dans PLOS Biology. Le titre est attirant : ‘Analysis of 567,758 randomized controlled trials published over 30 years reveals trends in phrases used to discuss results that do not reach statistical significance‘. Les auteurs sont partis de 567 000 essais […]

Le travail d’Erik Turner sur la publication (ou plutôt la non-publication) des essais cliniques d’antidépresseurs a commencé il y a plus de 40 ans. Son article de 2008 dans le NEJM a apporté des données probantes pour confirmer ce que tous les chercheurs devinaient, à savoir la publication des essais positifs et la non-publications des […]

Ce rapport de janvier 2022 s’inscrit dans le cadre du deuxième Plan National pour la Science Ouverte et de la conférence OSEC22 à l’occasion de la présidence française de l’Union européenne, avec l’appel de Paris. Ce rapport est bienvenu, et c’est dommage qu’il ne soit pas endossé par d’autres Académies, dont l’Académie de médecine..  discipline […]

J’aime bien les titres longs des articles de recherche car ils sont informatifs. Le titre de cet article de BMJ Open pourrait être traduit ainsi : Rayon de soleil sur les KOLs : évaluation de la nature, de l’étendue et de l’évolution des liens financiers entre les leaders des associations médicales professionnelles et l’industrie pharmaceutique […]

L’OFIS vient de mettre en ligne le numéro zéro de sa lettre mensuelle destinée aux acteurs de l’intégrité scientifique. C’est une bonne initiative, et vous pouvez vous abonner. Que contient ce numéro ? L’intégrité scientifique inscrite dans la loi : bonne analyse des textes qui mettent en oeuvre l’intégrité scientifique dans les établissements ; avec […]

Je dois remercier le Quotidien du Médecin de m’avoir proposé une rubrique mensuelle dans un format très contraint. Le format limité à une page oblige à rédiger succinctement, enlever les ‘bois morts’ tout en essayant de rester clair… en questionnant le lecteur sans l’offenser ;  cet exercice est difficile pour moi qui ne sais pas […]

Depuis quelques années le groupe Nature s’engage pour la transparence du peer-review et tout progresse. Nous ne sommes pas encore au peer-review totalement ouvert avec les noms des relecteurs, mais les données publiés dans un éditorial du 1 mars 2022 sont très encourageantes. J’ai repris ci-contre l’image de cet éditorial qui expose les taux de […]

La lecture du BMJ du 2 mars 2022 nous confirme qu’il est parfois très difficile de faire rétracter des articles par des revues. Une lettre appelle à rétracter un article du Lancet de 2008 concernant les greffes de trachée de Maccharini et al : Time to retract Lancet paper on tissue engineered trachea transplants Ce […]

Impressionnant, bien que je regrette de ne pas avoir lu en détail les 63 pages de ce livre blanc, mais je l’ai imprimé car il me plait. Le document compagnon est aussi excellent, avec 118 pages : Acceptabilité des « nouvelles méthodologies » pour l’évaluation des médicaments. Il y a 15 dossiers compagnons téléchargeables, notés […]

The editorial board of at least one journal, the Journal of Molecular Structure, has decided to no longer consider manuscripts authored by scientists working at institutions in Russia. Cette phrase ci-dessus est copiée d’une news de Nature du 1 mars 2022, à propos de la guerre en Ukraine. Doit-on boycotter les chercheurs russes en général […]

J’ai écouté la plupart des présentations lors du congrès virtuel européen OSEC 2022 ; ces Journées Européennes de la Science Ouverte se sont tenues à Paris les 4 et 5 février 2022, à l’occasion de la présidence française de l’Europe. Elles étaient très intéressantes. Outre toutes les vidéos, vous avez de courtes interview des principaux […]

C’est une équipe américaine qui a publié en novembre 2021 dans le BMJ une bonne recherche dont l’objectif était d’identifier tous les liens connus entre les industries des produits médicaux et l’écosystème de la santé. Excellent travail à partir de 538 articles provenant de 37 pays. Les 23 pages d’annexes permettent de voir la qualité […]

Sur le blog de PLOS ONE, remarquons un billet sur le management des cas d’intégrité et d’éthique difficiles, billet du 22 février 2022. Il faut 4 à 8 mois pour résoudre un cas : cela me semble plutôt bien, bien que ce soit long ! L’interview de Renée Hoch, ‘Senior Editor & Research manager of […]

C’est un mouvement nord-américain qui devrait nous concerner, et cet article de Nature de 5 pages est détaillé (24 février 2022, accès libre). Ce sont plus de 50 éditeurs représentant plus de 15 000 revues scientifiques qui se préparent à demander aux auteurs, relecteurs et rédacteurs des informations sur leur race et leur genre. Tout […]

Depuis les agressions de France Soir, relayées par D Raoult, envers un petit groupe d’experts, dont je fais partie, j’ai exploré les ressorts du complotisme et lu quelques ouvrages. Je fais partie de ceux qui, ayant exprimé leur avis sur l’inefficacité de l’hydroxychloroquine, sont promis à la guillotine. La violence des réseaux sociaux est intéressante […]

Je n’ai pas pour habitude de militer sur ce blog, sauf pour l’intégrité scientifique, et en lisant le livre ‘Mange et tais-toi‘ j’ai compris les enjeux pour une alimentation responsable. J’ai rempli le questionnaire proposé ci-dessous par S Hercberg… très important. La lecture de cet ouvrage, et du blog Nutri-Score,  permet de constater tous les […]