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Peer-Review Congress J3 : partage de données, commentaires après publication

Plaisir de voir une présentation française de l’équipe de Rennes (Locher, Naudet). C’est Maximilian Siebert qui a présenté ‘Data Sharing and Reanalysis for Main Studies Assessed by the European Medicines Agency’. Il a eu beaucoup de bonnes questions auxquelles il a bien répondu. Ils ont cherché les essais de médicaments approuvés par l’agence européenne entre […]

La complicité des Sociétés savantes qui aiment les revues de faible qualité

Le marché des revues scientifiques a toujours observé des transferts de revues entre les éditeurs. Si dans le passé, ces transferts étaient entre les grands éditeurs (Springer, Elsevier, Wiley, SAGE, Taylor & Francis, etc….), il semblent que les éditeurs de faible qualité attirent les Sociétés savantes naïves (il en existe !). Voici des billets récents […]

EDI, DIE, IDEA, IDEAS : de nouvelles exigences des revues concernant l’équité, la diversité et l’inclusion

Le mouvement se structure et les termes évoluent. Tout semble avoir commencé par les équilibres femmes-hommes dans les revues : disparités parmi les auteurs, les relecteurs, les comités de rédaction….  En bref, le système des mâles blancs aux têtes grises contrôlant le système de la recherche semble révolu…  C’est très bien car des convenances sociales […]

Une histoire de sexe : les revues scientifiques peuvent être politiquement engagées

Je raconte rarement mon témoignage du licenciement brutal de George Lundberg, rédacteur en chef du JAMA en janvier 1999. J’ai été témoin de cette histoire car j’étais membre du JAMA Editorial Board, et nous avons été convoqués en urgence à Chicago. Cet épisode permet de montrer les relations entre le propriétaire d’une revue scientifique (ici […]

Editorial commun de plus de 300 revues ‘COP27 : Une action urgente pour l’Afrique et le monde’

Suite à la conférence sur le changement climatique, ce sont plus de 300 revues scientifiques qui ont publié le même éditorial. La liste des revues est ici. Toutes les revues prestigieuses des groupe JAMA, Lancet et BMJ ont publié cet éditorial. Voici, par exemple, la version anglaise du JAMA Psychiatry, ou celle du Lancet. Il […]

La moitié des preprints COVID-19 sur medRxiv ont été publiés dans des revues à comité de lecture

C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : 40 à 60 % des preprints COVID apparaissent dans des revues Dans cette étude, nous avons identifié 3343 preprints liés à […]

Encore une démission d’un rédacteur en chef à propos des questions sur la diversité

Nous avons observé la démission de H Bauchner, rédacteur en chef du JAMA, suite à un podcast malencontreux sur le racisme. Un rédacteur en chef : je suis la victime Cette fois-ci, c’est le rédacteur en chef, Klaus Fiedler, de la revue Perspectives on Psychological Science, qui a démissionné. Une lettre ouverte de plus de […]

ChatGPT : performant non sourcé… co-auteur d’articles scientifiques (auteurs cadeaux ou fantômes ?)

Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est que le début des festivités. Beaucoup d’article sur ce phénomène, dont un éditorial du JAMA le 30 janvier […]

Pour se faire un bon CV, rien de tel qu’être membre d’un comité de rédaction

Article de Nature du 16 janvier 2023 dont le titre est repris ci-contre (article de 15 pages en accès libre). J’ai traduit le résumé en français : Parmi les rédacteurs en chef, 8 % sont des femmes Les rédacteurs scientifiques façonnent le contenu des revues universitaires et fixent les normes dans leur domaine. Pourtant, la […]

Peer Review Congress 9 : toutes les vidéos en ligne… une ressource incroyable

J’ai largement commenté des présentations du PRC9 en septembre 2022. Viennent d’être mises en ligne, en accès libre, toutes les vidéos des présentations ainsi que des pdf de posters. Très bien fait et agréable de revoir certaines présentations. Une ressource importante sur le fonctionnement des revues Attention, contrairement aux abstracts usuels de congrès, ce sont […]

Les nouvelles politiques du groupe JAMA impulsées par Kirsten Bibbins-Domingo

La nouvelle rédactrice en chef du JAMA et du JAMA Network semble changer un peu la maison. Des d’éditoriaux concernent la politique éditoriale du groupe depuis sa nommination, été 2022. Dépôt des manuscrits acceptés sur des archives ouvertes Cet éditorial de décembre 2022 a pour titre : ‘Public Access to Scientific Research Findings and Principles […]

Les méga-revues : un danger pour la science ? dégradation de la qualité du peer-review ?

Une opinion de JPA Ioannidis dans le JAMA, 20 mars 2023, nous apporte des informations sur ce modèle de publication qui met en péril certaines revues légitimes anciennes. Plus de 2 000 articles originaux ou revues de la littérature par an Est considérée comme méga-revue, une revue qui publie plus de 2 000 articles biomédicaux […]

Citer une revue systématique dans les articles des essais randomisés : oui, mais les bonnes sont très rares

Cela fait longtemps que des instructions aux auteurs de revues incitent à lier essais cliniques randomisés (ECR) et revues systématiques (RS). Une bonne pratique serait ce citer une RS dans l’introduction d’un article sur un ECR. Dans la discussion, il faut dire ce qu’un essai apporte à des RS. Par exemple, les instructions du Lancet […]

Les instructions aux auteurs des revues de neurosciences et physiologie n’incitent pas suffisamment aux pratiques responsables pour rapporter des résultats

Dans PLOS One le 30 mars 2023, des chercheurs australiens ont analysé les instructions aux auteurs des revues de neuroscience : Encouraging responsible reporting practices in the Instructions to Authors of neuroscience and physiology journals: There is room to improve Le message, c’est l’existence d’une marge d’amélioration… Rien n’avance vite, car la science ouverte, les […]

Intelligence artificielle et médecine : la pravda des chercheurs a une fille

Voici le premier article dans le New England Journal of Medicine (NEJM) sur Intelligence artificielle et médecine (avril 2023). Il est écrit par CJ Haugh et J Drazen. Il y a un éditorial ‘Artificial intelligence in medicine‘. Cet édito accompagne l’article dont le titre est Intelligence artificial and machine learning in clinical medicine, 2023. Une […]

Dans certains pays, dont la France, les professionnels de santé non médecins publient peu

Parmi les formations à la rédaction que je dispense, j’ai régulièrement des groupes de professionnels de santé dits ‘paramédicaux’. Ce sont surtout des infirmiers, plutôt des IPA (Infirmiers de pratiques avancées) et des masseurs-kinésithérapeutes. Quand la parole se libère sur les auteurs dans les publications, ils détaillent des pratiques paternalistes de la part des professions […]

New Ground : publication à suivre ? Initiative originale pour vulgariser des articles importants et informer les chercheurs

New Ground ou ‘Journal for Advances in Science‘ est un nouveau modèle de publication, assez original, probablement utile. C’est un billet du 15 mars 2023 de Scholarly Kitchen qui me l’a fait découvrir. C’est un modèle créé par un allemand près de Frankfort. Thilo Koerkel est le créateur et il a une expérience dans le […]

ChatGPT va changer rapidement les publications scientifiques

J’observe ce qui se passe et ChatGPT est une actualité donnant lieu à des publications dans toutes les revues scientifiques. La prestigieuse revue Radiology a publié un commentaire de deux pages d’un jeune radio-pédiatre (février 2023). Il a déjà soumis une quinzaine d’articles qui ont été écrits avec ChatGPT et cinq ont été publiés. Tout […]

Actualisation des recommandations ICMJE avec des paragraphes sur l’intelligence artificielle

L’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors), ancien groupe Vancouver, actualise chaque année ses : Recommandations pour la conduite, la présentation, la rédaction et la publication des travaux de recherche soumis à des revues médicales. Outre des toilettages habituels, petites précisions que je ne rapporte pas (disponibilité des données pour les relecteurs, mention des lignes […]

Les instructions aux auteurs des journaux ont été adaptées à l’usage de l’intelligence artificielle (IA)

D’accord pour utiliser l’IA mais dans la transparence Toutes les revues scientifiques révisent leurs instructions aux auteurs pour préciser les règles applicables à l’arrivée de l’intelligence artificielle. Le groupe Elsevier a adapté ses instructions pour les éditeurs, rédacteurs, relecteurs et auteurs. Les instructions sont assez semblables, et traduisons celles pour les auteurs : « Cette politique […]

Simplifions les soumissions d’articles plutôt que reformatter en permanence des manuscrits

C’est une news du 8 juin 2023 dans Nature intitulée : Revealed: the millions of dollars in time wasted making papers fit journal guidelines qui attire notre attention sur un gaspillage majeur. Cette news commente un travail d’une équipe danoise dans BMC Medicine, avec comme titre Saving time and money in biomedical publishing: the case […]

Trop de chercheurs n’ont pas compris que faire une revue systématique est une recherche faite en équipe

Cet article de 29 pages (et 234 références) est publié simultanément par 7 revues de spécialités différentes en juin 2023 : BMC Infectious Diseases, Acta Anaesthesiologica Scandinavica, BMC Systematic Reviews, the British Journal of Pharmacology, JBI Evidence Synthesis, the Journal of Bone and Joint Surgery Reviews, and the Journal of Pediatric Rehabilitation Medicine. Faire de […]

Recommandations pour améliorer les relations entre institutions et journaux scientifiques pour gérer des méconduites

En bref : la qualité des données est une problématique des revues ; identifier les coupables est une problématique des institutions. Il s’agit d’un domaine qui dysfonctionne : les journaux se plaignent des institutions qui ne répondent pas aux demandes d’investigation sur des données d’un manuscrit en cours d’évaluation, voire après publication. Inversement, les institutions […]

Concordance plutôt bonne entre 535 preprints de medRxiv et leurs publications ultérieures

Cet article de JAMA Open suggère que la plupart des études cliniques publiées en tant que preprints sur medRxiv et publiées par la suite dans des revues à comité de lecture avaient des caractéristiques d’étude, des résultats et des interprétations finales plutôt concordants. C’est rassurant. Ces études portent sur des articles publiés après mise en […]

Président d’une section de CNU, Rédacteur en chef et Guest Editor chez MDPI : quel message pour les candidats ?

Cherchez l’erreur : Nutrients est une revue du groupe mercantile MDPI (zone grise des revues de faible qualité). Nutrients a un passé sulfureux car 10 membres du comité de rédaction ont démissionné brutalement en 2018…  ils n’acceptaient pas assez d’articles… Des éditeurs mercantiles n’ont pas été inclus dans la liste des revues présumées non prédatrices […]

Que font les professionnels de santé pour alerter sur les risques de guerre nucléaire ?

Un éditorial a été publié simultanément par plus de 100 journaux scientifiques en août 2023. En accès libre, il a été signé par les rédacteurs de revues prestigieuses, BMJ, Lancet, NEJM, JAMA et autres… Son titre : Reducing the risks of nuclear war — The role of health professionals. Il m’a fait prendre conscience de […]

PNAS : comparaison des articles soumis par voie directe ou par la voie dite ‘Contributed submission’

PNAS : soumission par les membres NAS ou les non-membres Le journal PNAS est très prestigieux. Sur son site ‘The Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), a peer reviewed journal of the National Academy of Sciences (NAS), is an authoritative source of high-impact, original research that broadly spans the biological, physical, and social […]

Les pratiques frauduleuses des paper mills : payer des rédacteurs en chef pour accepter des articles

Cet article (news) publié le 19 janvier 2024 dans Science décrit des fraudes majeures avec des exemples très précis. Nous avons souvent évoqué les ‘paper mills‘, ces sociétés qui écrivent, reprennent, inventent des articles et proposent à des chercheurs de les signer, contre payement bien sûr. Le phénomène est mal connu, mal décrit et semble […]

Instructions aux auteurs concernant l’utilisation de l’intelligence artificielle dans les articles

Cet article du BMJ le 31 janvier 2024 est de bonne qualité, et intéressant. Article en accès libre, comme tous les articles de recherche du BMJ, mais éditorial sous paywall ! Si j’avais été relecteur, je me serai opposé à l’inclusion d’environ 30 éditeurs prédateurs parmi l’échantillon de 100 éditeurs. Les instructions sur l’utilisation de […]

Cas IS n° 9 : Ajouter des références à la demande du rédacteur en chef

Situation réelle… j’ai vu la lettre !! Très nord-américain !!! Enfin mon manuscrit a été accepté par une revue prestigieuse Le manuscrit de ma recherche vient d’être accepté après plusieurs commentaires et échanges avec les relecteurs (peer-review)… cela a pris beaucoup de temps et demandé des analyses complémentaires. Le rédacteur en chef vient de m’envoyer […]

La recherche chirurgicale s’adapte trop lentement aux pratiques de la science ouverte

C’est une courte lettre de recherche dans JAMA surgery en décembre 2023 évaluant l’adoption de la science ouverte par les milieux académiques. Désolant car le retard est grand par rapport à certaines disciplines. Ce sont 8 journaux de chirurgie qui ont été analysés : JAMA Surgery, Annals of Surgery, British Journal of Surgery, Journal of […]

Les revues de faible qualité prospèrent avec des rédacteurs complaisants, mais certains démissionnent

C’est un tweet de Retraction Watch (RW) le 25 février 2024 qui nous informe sur la démission en mai 2023 de 31 rédacteurs de la revue Frontiers in Sustainability. Il arrive que des comités de rédaction, des rédacteurs soient en conflit avec l’éditeur. Sur Retraction Watch, il y a une liste de 29 cas de […]

L’année 2023 du JAMA : comment évaluer les 275 manuscrits reçus chaque semaine ?

Avec un facteur d’impact de 120, le JAMA, comme les V5 (Annals, BMJ, JAMA, Lancet, NEJM), publie en général des articles de qualité. Comme tous les journaux du groupe JAMA, chaque année sont publiées les données de l’année précédente (article du 8 mars 2024). Je vous laisse voir une partie des informations dans l’image ci-dessous. […]

Les origines des rédacteurs américains sont diverses au sein des 13 revues du groupe JAMA

Nous sommes dans ces mouvements DEI (Diversity, Equity, Inclusion) en Amérique du nord, et dans de nombreux autres Pays. La Société royale de chimie (UK) a fédéré les actions au sein du Joint Commitment for Action on inclusion and diversity in publishing. C’est un réseau de 56 éditeurs qui regroupe environ 15 000 revues. Les […]

La lutte contre les ‘paper mills’ s’organise avec United2Act sous l’égide de COPE et STM

C’est un billet de Scholarly Kitchen (27 février 2024) qui m’a fait découvrir ce projet. Il s’agit d’un projet sous l’égide de COPE et de STM. Son nom : UNITED2ACT Against Paper Mills. Ce projet sera présenté à la prochaine conférence mondiale de l’intégrité, Athènes, début juin 2024. Le rapport 2022 sur les paper mills […]

Comment évoquer la santé et la guerre dans les journaux scientifiques, sans être militant d’une cause ?

Nous avons évoqué hier la série d’articles du NEJM (New England Journal of Medicine) intitulée ‘Recognizing Historical Injustices in Medicine and the Journal‘. Le NEJM a été silencieux entre 1935 et 1944 sur ce qui se passait en Allemagne, alors que le JAMA (Journal of the American Medical Association) publiait les lettres d’un correspondant à […]
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