Le conseil de déontologie scientifique et de médiation (CDJM) a publié début décembre 2022 des recommandations pour mieux traiter l’information scientifique dans les médias. Le document consultable sur le site et téléchargeable commence ainsi : Le traitement de l’information scientifique exige une attention spécifique en matière de déontologie journalistique. Changement climatique, pandémies, modèle agricole, débat sur […]

C’est toujours une bonne nouvelle que d’accueillir une nouvelle publication scientifique. Il s’agit des Carnets d’Histoire de la Médecine, publiés par la Faculté de Médecine de Tours. Le premier numéro a été mis en ligne et vous pouvez le télécharger gracieusement. Chaque numéro semestriel comprendra un dossier d’articles sélectionnés par un comité de lecture, rédigés […]

Une fois de plus, j’ai l’immense honneur d’être invité comme orateur à une conférence virtuelle. Quel honneur… Le principal semble que je paye en tant que speaker. Que je ne connaisse rien au sujet n’est pas important ! Nous recevons régulièrement ces invitations, et des collègues répondent favorablement… En cliquant sur le lien du message, […]

Une nouvelle revue électronique sous le modèle dit diamant est née ! Emerging neurologist est un projet intéressant porté par de jeunes neurologues. C’est la revue de la Fédération Internationale des Jeunes Neurologues Francophones. Cette revue avec une relecture des articles en double aveugle publie des articles de recherche, des cas cliniques et des revues […]

Je connais mal ce domaine, mais j’ai observé une société (Proofig) qui propose de détecter les manipulations d’images. Des éditeurs ont contracté avec cette société, Taylor & Francis, SAGE, Mary Ann Liebert et d’autres revues ont adopté ce système basé sur l’intelligence artificielle. Cette société a une adresse en Israël. L’American Association for Cancer Research […]

La conférence PUBMET, créée en 2014, est organisée par l’Université de Zadar, Department of Information Sciences, Centre for Scientific Information of the Ruđer Bošković Institute, University of Zagreb, Croatian Association for Scholarly Communication, and University of Rijeka, Faculty of Medicine. Le livre des abstracts de la conférence 2022 en présentiel de mi-septembre à Zadar, est […]

Simon Linacre, qui a travaillé chez Cabells de 2018 à 2022, vient de publier (novembre 2022) un ouvrage en libre accès intitulé ‘ The Predator Effect: Understanding the Past, Present and Future of Deceptive Academic Journals ‘. Cabells a une liste payante de 16 000 revues prédactrices (mai 2022), comparée à la liste de 12 […]

Je viens de lire, avec un certain plaisir, un livre qui raconte le scandale des implants Essure. Ce sont des témoignages de femmes auxquelles ont été implantées ces ‘devices’ dans les trompes pour assurer une contraception. En pratique, ces implants n’auraient jamais dû être commercialisés puis implantés. Les gynécologues et Bayer (qui a acheté Conceptus), […]

Fin novembre 2022, le BMJ a publié un article d’auteurs espagnols et américains analysant les rétractations d’articles provenant de paper mills (usines à articles). Voici une traduction des résultats du résumé : 1182 articles rétractés provenant d’usines à articles ont été recensés. La publication du premier article remonte à 2004 et la première rétractation remonte […]

Le numéro 10369  du 17 décembre 2022 du Lancet contient plusieurs articles sur les apports de Louis Pasteur à la science. L’éditorial ‘Pasteur’s legacy in 21st century‘ nous précise qu’il est né le 27 décembre 1822 et liste les articles de ce numéro avec les messages principaux. J’ai parcouru les articles et lus certains en […]

C’est le JAMA Ophthalmology qui, fin octobre 2022, a publié un viewpoint intitulé ‘Sex and Gender Reporting in Ophthalmology‘. Les termes sexe et genre sont parfois mal compris, voire intervertis, et moi le premier, je confonds ces concepts ! Voici un extrait de cet article, et je reprends le glossaire qui est bien fait (image […]

En fin d’année, certaines revues nous informent sur l’attention des articles de l’année dans les réseaux sociaux (news, blogs, twitter, facebook, wikipedia, reddit, …). En général, ces scores Altmetric sont fugaces car en, quelques jours après la publication, la plupart des discussions sont faites. Le JAMA a publié sa liste Top 10 2022. Sur ce […]

Cet exemple met en valeur la nécessité de revisiter les articles publiés, car le peer review ne voit pas des trucs grossiers. Si j’avais été reviewer de cet article, concentré sur le fond, peut-être aurais-je loupé cette petite coquetterie d’un histogramme. J’ai reproduit l’image de cet article maintenant rétracté : ce sont bien des lettres […]

Conférence simple et brilliante de Brian Nosek lors du congrès du Peer Review en septembre 2022. Voici le lien à l’abstract et à la vidéo reprise ci-dessous, avec pour titre ‘Improving the Research Culture to Increase Credibility of Research Findings‘ Nous connaissons bien les Registered Reports (RRs), manuscrits soumis à une revue sous forme d’un […]

C’est toujours incroyable, car les enseignants protègent habituellement leurs collègues. C’est une dépêche d’AEF Info reprise sur le site de Challenges le 29 décembre 2022. Voici ce qui est rapporté : La section disciplinaire du conseil académique de l’université Paris-VIII, réunie le 21 septembre 2022, a prononcé « l’interdiction d’accéder à une classe, grade ou corps supérieurs pendant […]

J’ai préparé 16 vidéos de 4 minutes en moyenne pour aider les internes en médecine lorsqu’ils doivent préparer leur thèse. Chaque vidéo sera mise en ligne avec un billet sur ce blog pour la présenter. Avec chaque vidéo, un document pdf de 4 à 8 pages sera téléchargeable avec exemples et références. La définition de […]

Dans ce module 1 du guide du thésard, les principes d’une thèse d’exercice sont présentés. Ce rite de passage se fait dans la souffrance. Les mauvais souvenirs sont vite oubliés. La thèse de médecine et l’article de recherche suivent la même démarche…  mais la formalisation diffère. Il est plus difficile d’écrire un article de 3500 […]

Un bon directeur et c’est gagné Pourquoi faire une thèse ? Par plaisir, pas seulement. Il faut questionner ses collègues pour apprendre de leurs succès et épreuves. Savoir choisir un sujet, un directeur de thèse sont importants. Il faut préparer un rétroplanning (sur 12 mois par exemple) pour éviter le crash final ! Tu disposes […]

Tu auras parfois besoin de soutiens pour rester motivé. Pour réussir ta thèse, l’environnement professionnel et familial compte. Ta formation aux méthodes de recherche et les conditions matérielles de ton travail doivent être prises en compte. Ce module 3 présente quelques informations. De bons outils La recherche documentaire : se faire aider. C’est la première […]

Suite à la conférence sur le changement climatique, ce sont plus de 300 revues scientifiques qui ont publié le même éditorial. La liste des revues est ici. Toutes les revues prestigieuses des groupe JAMA, Lancet et BMJ ont publié cet éditorial. Voici, par exemple, la version anglaise du JAMA Psychiatry, ou celle du Lancet. Il […]

FTA en 2020 en France : 30 millions € C’est un rapport publié le 4 janvier 2023 et accessible sur le site Ouvrir la Science du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Le rapport (57 pages) de décembre 2022 est en anglais et accessible sur HAL. Le rapport évoque les APC (Article Processing […]

Les albums de Tintin ont souvent fascinés des collègues qui ont analysé la place de la médecine dans ces 23 albums. Félicitons JL Vanherweghem et la Revue Médicale de Bruxelles pour l’article paru dans le numéro de novembre-décembre 2022 : L’image de la médecine dans les aventures de Tintin. Cet article sur l’image n’a pas […]

T’aider pour préparer une question de recherche. Apprend à poser la question de recherche ; évaluer l’écart entre la littérature et les pratiques : le mieux serait d’avoir une revue systématique (voir module 12) ; la question doit être éthique, nouvelle, intéressante, faisable et pertinente ; PICOT pour : Patient, Intervention, Comparaison, Outcomes, Temps. La […]

Le plan IMRaD de ta thèse doit répondre à 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (Introduction) ? Comment j’ai fait ce travail (Méthodes) ? Qu’est-ce que j’ai observé (Résultats) ? Qu’est-ce que j’en pense (Discussion) ? L’introduction est donc un entonnoir et doit être courte.  Sauf si ton directeur te le demande, ne copie pas toutes les […]

La deuxième question du plan IMRaD est : Comment j’ai fait ce travail ? Ce sont les méthodes de ta thèse ou de ton article. Tu dois décrire avec précision comment tu as travaillé, sans omettre tous les détails, mêmes les plus évidents. Ton lecteur devrait pouvoir refaire le même travail. Trois parties qui s’appliquent […]

C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : 40 à 60 % des preprints COVID apparaissent dans des revues Dans cette étude, nous avons identifié 3343 preprints liés à […]

La naissance d’une nouvelle revue scientifique est toujours bienvenue et lancer un premier numéro au temps de l’électronique est plus facile qu’envoyer des numéros papiers pour prospecter des clients. Il s’agit d’une revue en accès libre avec pour titre The Journal of Beatles Studies. Génial. Beatlemania L’article 80 to 80 commence ainsi Exactly one week […]

Une recherche responsable ! Ta recherche doit respecter tous les principes d’une recherche responsable, c’est-à-dire respecter les directives, bonnes pratiques et règles d’éthique qui s’appliquent à la recherche. Tu dois être intègre, en étant totalement honnête, sans cacher des données. Pour les recherches cliniques, considère la loi Jardé en France. Tu dois relire la déclaration […]

Des temps des verbes au passé ? Le plan IMRaD de ta thèse, ce sont 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (introduction, module 5) ? Comment j’ai fait ce travail (méthodes, module 6) ? Qu’est ce que j’ai observé (résultats, ce module) ? Qu’est-ce que j’en pense (discussion, module 9) ? Note que […]

Répondre à la question La discussion commence très naturellement par répondre à ta question de recherche. Pour cela, tu résumes brièvement le(s) résultat(s) principal(aux) en mettant en valeur les aspects nouveaux et importants. La thèse, comme l’article original d’une revue scientifique, correspond à deux entonnoirs (intro puis renverse l’entonnoir pour la discussion). L’objectif de la […]

Une BD collector J’ai vite acheté la bande dessinée  sur le Mediator écrite et illustrée par Eric Giacometti, Irène Frachon et François Duprat. Félicitons les éditions Delcourt pour cette publication, et la qualité de l’iconographie. Mon libraire de BD du quartier venait de recevoir des exemplaires et je lui ai suggéré de les mettre en […]

La mort de la gestion du savoir par les académiques Certains prétendent que les revues de groupes comme MDPI, Frontiers, Bentham, et autres ne sont pas des revues prédatrices ! Ce sont surtout des revues mercantiles. Incroyable, ce sont des universitaires avides de publier vite sans risques d’être refusé par la revue. Payer pour ce […]

Avant de commencer ta thèse, consulte les instructions de ta faculté, des instructions pour bien écrire et autres recommandations Chaque faculté publie sur son site des instructions pour la thèse. Il faut les consulter. Elles sont détaillées pour décrire les formalités administratives, et apportent quelques guides pour la dactylographie et la présentation. Certaines instructions contiennent […]

Le style scientifique n’est pas le style littéraire. Nous avons appris à bien écrire, dans l’esprit des grands auteurs de la littérature. Urgence, il faut tout oublier en science : Le meilleur style est l’absence de style Comprends comment lisent les chercheurs en science : ils préfèrent ce qui est court, ils vont vite aux […]

La revue systématique est une recherche qui se développe. Faire une revue systématique (RS) demande du temps, de la rigueur et une collaboration avec des collèges. Bien faite (ce qui est rare), la RS est une recherche qui permet d’analyser la littérature. Il s’agit d’identifier, de sélectionner, d’évaluer et de résumer des études primaires, des […]

Une circulaire du ministère de la santé a du échapper au ministre. La censure est l’apanage de régimes autoritaires… effacer l’histoire n’est pas acceptable dans une démocratie. Ces fonctionnaires ne doivent pas utiliser de passe plat à la cantine (voir image mise en avant avec le passe plat ouvert…  trouvez l’image quand c’est fermé). L’adieu […]

Le numéro de Science & Pseudo-sciences de début 2023 est dans les kiosques. Sur le site de l’AFIS, vous aurez accès au dossier de presse et au sommaire. Des articles sont présentés dans le dossier de presse (image ci-contre de la page 2). ‘Tests microbiote, Science ou pseudo-science ?’ par Geneviève Héry-Arnaud (Brest) est au […]

Nous avons observé la démission de H Bauchner, rédacteur en chef du JAMA, suite à un podcast malencontreux sur le racisme. Un rédacteur en chef : je suis la victime Cette fois-ci, c’est le rédacteur en chef, Klaus Fiedler, de la revue Perspectives on Psychological Science, qui a démissionné. Une lettre ouverte de plus de […]

Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est que le début des festivités. Beaucoup d’article sur ce phénomène, dont un éditorial du JAMA le 30 janvier […]

Les articles écrits par ChatGPT, ou sur ChatGPT, sont de plus en plus nombreux. Dans la revue Arthroscopy, une courte lettre du 31 janvier 2023 a pour titre : ‘How Will Artificial Intelligence Affect Scientific Writing, Reviewing and Editing? The Future is Here…’. Pourquoi a-t-elle été acceptée et publiée ? Un éditorial écrit par le […]

Trop de titres de thèse sont peu informatifs et pas très attirants. Il y a trois types de titres : informatifs, indicatifs, interrogatifs. Il faut choisir entres ces trois possibilités… pas toujours facile. Titre actif avec verbe et résultat pour mieux diffuser tes travaux ! Il est possible (voire souhaitable) de mettre un verbe actif […]

Attention, trop de références sont un étalage de confitures alors que quelques références bien choisies sont très utiles. Ne retiens que des références avec des données probantes pour convaincre, donc essentiellement des articles originaux. 25 à 30 % des références ne contiennent pas ce que l’on leur fait dire Va d’urgence lire un article en […]

Ce dernier rite de passage doit être bien préparé. La forme (habillement, respect du temps, empathie, clarté) a de l’importance. Une thèse mal présentée met le jury de mauvaise humeur. Un rite de passage codifié par la faculté, et rapide… Les instructions sur la composition du jury sont détaillées et doivent être respectées. Tu as […]

Cet article de début 2023 apporte des données originales sur le devenir des articles commentés sur PubPeer, site qui contient environ 100 000 commentaires sur des articles. Le titre : ‘How do journals deal with problematic articles. Editorial response of journals to articles commented in PubPeer‘. Cette recherche a été faite par deux chercheurs en […]

Trop de thèse sont un transfert d’os d’une tombe dans une autre. Elles plaisent à un vieux jury qui se congratule, mais ne se demande pas si la thèse aura une vie après la soutenance. Une recherche dont les résultats ne sont pas diffusés est un travail perdu. Un travail n’est terminé que quand il […]

C’est une belle réflexion d’un journaliste américain publiée dans Nature, sur 3 pages, le 13 février 2023. Le titre sur le site : Stop the peer-review treadmill ! Trouver des relecteurs !!! Il relate toutes les difficultés pour trouver des relecteurs pour les 3 millions d’articles soumis annuellement à des revues scientifiques (2016) ; c’était […]

J’ai découvert un livre plein d’informations sur les revues scientifiques. Je l’ai lu (non survolé) avec beaucoup de plaisir, survolé car il fait 643 pages ! S’il est téléchargeable gratuitement, j’ai préféré l’acheter pour mieux en profiter. J’ai écouté plusieurs fois Aileen Fyfe, première autrice, et son travail d’historienne est passionnant. Dans ce livre, c’est […]

Article de Nature du 16 janvier 2023 dont le titre est repris ci-contre (article de 15 pages en accès libre). J’ai traduit le résumé en français : Parmi les rédacteurs en chef, 8 % sont des femmes Les rédacteurs scientifiques façonnent le contenu des revues universitaires et fixent les normes dans leur domaine. Pourtant, la […]

J’ai largement commenté des présentations du PRC9 en septembre 2022. Viennent d’être mises en ligne, en accès libre, toutes les vidéos des présentations ainsi que des pdf de posters. Très bien fait et agréable de revoir certaines présentations. Une ressource importante sur le fonctionnement des revues Attention, contrairement aux abstracts usuels de congrès, ce sont […]