En lisant le centre de ressources IA du groupe JAMA, j’ai repris un article ayant déjà un an et cité bientôt 650 fois car il a été beaucoup commenté. Le score Altmetric est élevé avec 6 238 (6 mai 2024) et liste 6647 tweets (pour 37 millions de suiveurs), 546 news dans des médias (et […]

Tout va trop vite et se tenir à jour va être complexe. Dans PubMed seulement, il y a eu 16 419 articles indexés en 2019, 22 686 en 2020, 31 427 en 2021, 39 014 en 2022, 38 233 en 2023…   soit un doublement en moins de 4 ans. Peut-on prévoir 100 000 articles en […]

J’aime bien le GRAS Le GRAS signifie Groupe de Recherche pour l’Action et la Santé. Je suis le travail de ce groupe de collègues belges depuis quelques années. Sur leur site : Le GRAS est mouvement de veille éthique soucieux de promouvoir de bonnes pratiques de soins de santé et une médecine indépendante. Il regroupe […]

J’ai été invité pour faire très brièvement l’histoire de l’EBM (Evidence-based-Medicine) pour des médecins généralistes. C’était la préconférence annuelle de Fayr GP, palais des congrès, Paris en mars 2024. Faut-il remplacer l’EBM ? Oui mais par quoi ? J’ai repris mon propos dans la vidéo de 8 minutes ci-dessous. Archie Cochrane dans sont livre de […]

Paraphraser  : est-ce plagier ou non ? Une revue de sciences sociales a publié une revue de la littérature de 25 pages. Ce article a été apprécié du comité de rédaction car il sera probablement cité, ce qui fera augmenter le facteur d’impact de la revue. La rédaction a reçu un courrier d’un lecteur signalant […]

Le dernier numéro de S&PS, revue de l’Afis (Association Française pour l’Information Scientifique) est en kiosque, et est arrivé chez les abonnés. Dossier Science et justice Articles passionnant pour comprendre que la justice prend des décisions sur un jugement de la situation, sans être obligatoirement liée à la science ou à l’absence de données scientifiques. […]

Les recommandations pour utiliser l’IA (intelligence artificielle) sont de plus en plus nombreuses pour les chercheurs. Nous avons vu que les revues scientifiques avaient adaptés les instructions aux auteurs. L’usage responsable de l’IA générative en recherche Ces recommandations de la commission européenne sont logiques : utilisez l’IA, soyez explicite, et restez responsable de vos écrits […]

Toujours bienvenues, des déclarations signées par des institutions..  mais signer ne veut pas dire appliquer !! Dommage. La déclaration de Barcelone en avril 2024 Un site internet nous apporte toutes les informations sur cette bonne initiative, suite à une réunion de novembre 2023 à Barcelone. Il est habituel d’ajouter un nom comme une ville pour […]

Lors du congrès de médecine générale, fin mars 2024, à Paris, j’ai été invité dans une session sur l’intelligence artificielle. Nicolas de Chanaud a brillamment présenté toutes les applications dans la pratique de la médecine générale. Un autre exposé de Mathieu Jeandron d’Amazon Web Services intitulé ‘La vision d’un industriel sur l’IA en santé’ nous […]

Enfin, je suis relecteur pour une revue prestigieuse Vous êtes un étudiant et vous terminez votre thèse de doctorat en sciences. Vous êtes invité à relire un manuscrit pour un journal pour la première fois. Le système d’évaluation par les pairs assure la qualité des revues et vous êtes excité de faire partie des experts […]

Il faut aller vite pour utiliser les LLM (Large Language Models), ces outils qui nous aident pour écrire des articles. C’est une recherche publiée début avril 2024 dans JMIR (Journal of Medical Internet Research). Les journaux du groupe JMIR ont, à ce jour, publié bientôt 150 articles sur l’intelligence artificielle (IA) dans le domaine de […]

Nous avons évoqué hier la série d’articles du NEJM (New England Journal of Medicine) intitulée ‘Recognizing Historical Injustices in Medicine and the Journal‘. Le NEJM a été silencieux entre 1935 et 1944 sur ce qui se passait en Allemagne, alors que le JAMA (Journal of the American Medical Association) publiait les lettres d’un correspondant à […]

En décembre 2023, j‘ai présenté une série d’articles du NEJM (New ENgland Journal of Medicine), avec un éditorial et un article sur l’esclavage. J’ai eu des commentaires bienvenus. La série, Recognizing Historical Injustices in Medicine and the Journal,  continue avec : le 4 janvier 2024 : Indigenous Americans — The Journal’s Historical “Indian Problem” le […]

C’est une news du 1 avril 2024 dans Science qui nous informe de la décision de la Fondation Bill & Melinda Gates. De nombreux articles ont commenté cette politique, par exemple Nature, Pour toutes les recherches financées par la fondation, à partir de 2025, les chercheurs devront déposer des preprints pour leurs résultats (manuscrits qui […]

Un truc fréquent ? Un collègue respecté explique fièrement comment il a publié 12 articles, à partir d’analyses de la base qu’il a créée lors de sa thèse. Il a fait une enquête électronique sur des pratiques de laboratoire avec un questionnaire de quatre pages et il a eu 230 réponses. Il a des données […]

Nous sommes quatre ans après la mise en évidence des frasques de D Raoult pendant la pandémie de la COVID-19. Nous savons que tout avait commencé bien avant 2020. Tout était clair dès 2006, année pendant laquelle des revues américaines de microbiologie avaient refusé de considérer ses articles ! Mais seuls les initiés savaient que […]

C’est The Lancet du 6 avril 2024 qui rend hommage à un prix Nobel Français, Roger Guillemin, né à Dijon. Il est mort le 21 février 2024 en Californie, USA, à l’âge de 100 ans. Cet endocrinologue français a été naturalisé américain en 1965 et a reçu son prix Nobel de médecine et physiologie en […]

Le GEMASS (Groupe d’Etude des Méthodes de l’Analyse Sociologique de la Sorbonne) est une unité mixte de recherche (UMR 8598) associée à Sorbonne Université et au Centre national de la recherche scientifique (CNRS). Ils ont fait une enquête en 2022 auprès des personnels du Cnrs, et maintenant, c’est l’Inserm. Le rapport 2024 de cette enquête […]

Je vous ai plusieurs fois alerté sur les revues prédatrices et aussi sur les revues dites de faible qualité, toutes profitant d’un nouveau marché, à savoir des chercheurs prêts à publier en payant. Je remercie la Société Française du Cancer pour son invitation à présenter cette crise du savoir. Après une introduction de Jacques Robert, […]

Assurer des ressources pour poursuivre mes recherches J’ai rendez-vous avec le directeur du département pour lui montrer les résultats de mes recherches. Je sais que quelques observations ne donnent pas les résultats attendus. Je montre les données au directeur et nous travaillons sur les données. Le tableur est sur l’écran de l’ordinateur. Après réflexion, mon […]

C’est un billet de Scholarly Kitchen (27 février 2024) qui m’a fait découvrir ce projet. Il s’agit d’un projet sous l’égide de COPE et de STM. Son nom : UNITED2ACT Against Paper Mills. Ce projet sera présenté à la prochaine conférence mondiale de l’intégrité, Athènes, début juin 2024. Le rapport 2022 sur les paper mills […]

Cette question mérite d’être posée, mais la réponse n’est pas évidente. C’est un point de vue défendu dans le BMJ le 27 mars 2024 qui pose la question. Le BMJ appartient au BMJ Publishing group et ne joue pas dans la même cour que les grands éditeurs. L’auteur, Brian Owens, est un journaliste vivant au […]

Cette photo de mars 2024, volée sur X, me rappelle l’histoire du BMJ que j’ai d’abord connue avec Stephen Lock dans les années 80s. Ces quatre médecins ont été les rédacteurs en chef du BMJ depuis 1975. Stephen Lock, 94 ans, editor 1975 – 1991 Je suis entré au CA de EASE quand S Lock […]

Un bon article dans une revue française Je viens de publier un article en français dans une revue de ma spécialité. C’est un gros travail et l’article a été facilement accepté par des collègues. Au vu des commentaires des relecteurs, je réalise qu’il y a une opportunité pour publier cette recherche en langue anglaise dans […]

Le titre de ce billet est un des messages d’un excellent article investiguant le comportement des chercheurs faisant des synthèses de la littérature vis-à-vis des journaux prédateurs. Cet article publié fin 2023 dans une revue Wiley ‘Research Synthesis Methods’ a pour titre « Predatory journals and their practices present a conendrum for systematic reviewers and evidence […]

Je suis respectueux des religions mais quand on me sollicite pour payer probablement pour recycler des trucs qui seront acceptés avec un peer reveiw probablement sous-traité à une intelligence artificielle, cela me chatouille.

Les places seront vite épuisées…  car c’est gratuit et le panel des intervenants est impressionnant. Les REC 2024 se déroulent le samedi 27 et le dimanche 28 avril 2024. Inscrivez-vous sur REC et profitez d’un week-end à Toulouse. Avant tout, félicitons le maître d’oeuvre, Willy Lafran… impressionnant car l’équipe est réduite. Un programme dense avec […]

Le JAMA Network Open, en mars 2024, a publié une revue systématique sur la citation des articles retirés de la littérature Un domaine problématique pour les rétractations : microRNA Parmi les rétractations en génétique, il semble que le domaine microRNA représente 50 à 60 % des rétractations. Des études ont montré que les articles retirés […]

Dans quel labo faire ma thèse ? Depuis trois mois, je suis dans un labo et je dois choisir d’ici un mois où je ferais ma thèse pour un doctorat (PhD pour Philosophiæ doctor). Dans le laboratoire où je suis, le directeur est pressé et il y a beaucoup de pression. Il publie beaucoup d’articles […]

Des études incluses de mauvaise qualité C’est une revue systématique avec méta-analyse d’enquêtes sur la pratique dite des auteurs honoraires. Ce sont ces collègues ajoutés dans la liste des auteurs par complaisance. En général, ils n’ont rien fait et penseront qu’il faut renvoyer l’ascenseur. C’est une stratégie gagnant-gagnant voire plutôt perdant-perdant. Cet article de 15 […]

Nous sommes dans ces mouvements DEI (Diversity, Equity, Inclusion) en Amérique du nord, et dans de nombreux autres Pays. La Société royale de chimie (UK) a fédéré les actions au sein du Joint Commitment for Action on inclusion and diversity in publishing. C’est un réseau de 56 éditeurs qui regroupe environ 15 000 revues. Les […]

BMC Methodological Research Methodology a publié début 2024 un bon article de nos collègues du centre d’épidémiologie clinique de l’Hôtel-Dieu, Paris. L’objectif a été de comparer des preprints aux articles ensuite publiés dans des revues. Ce sont des préprints d’essais contrôlés randomisés (ECR) qui ont été étudiés. Méthodes bien décrites,… je passe. J’ai regardé les […]

Après les conflits d’auteurs, les citations inappropriées, les problèmes de stat sont fréquents Je commence l’analyse de mes données. J’ai utilisé des méthodes statistiques, essentiellement des tests prévus au départ dans le protocole La signification statistique est peu satisfaisante : les résultats sont non significatifs ou très peu significatifs donc je n’arriverai probablement pas à […]

Un rapport sur les systèmes d’IA générative en santé vient d’être mis en ligne après avoir été largement accepté par l’Académie. Il y a trois auteurs dont un chirurgien (Nordlinger) en premier auteur. Le rapport ne dit pas grand chose sur IA et publications. C’est un très large panorama sur l’arrivée de l’IA et c’est […]

Avec un facteur d’impact de 120, le JAMA, comme les V5 (Annals, BMJ, JAMA, Lancet, NEJM), publie en général des articles de qualité. Comme tous les journaux du groupe JAMA, chaque année sont publiées les données de l’année précédente (article du 8 mars 2024). Je vous laisse voir une partie des informations dans l’image ci-dessous. […]

Ce livre est un roman écrit par l’une de nos collègues, et il se lit facilement, avec envie de poursuivre d’un chapitre à l’autre. Les chapitres sont courts, ce qui est agréable. Vite lu car il est passionnant et il présente très bien le parcours de 12 ans d’une héroïne, Manon, qui fait ses études […]

Nous allons fêter les 4 ans de pandémies, et surtout les 4 ans de dérives du druide des calanques sans qu’il ait été menacé. Il va bien, continue ses activités complotistes, sauf que son audience baisse lentement. C’est l’heure des comptes nous dit la prestigieuse revue Science Cet article de 5 pages du 7 mars […]

Les thèses d’exercice en médecine sont un étonnement sans fin. Je côtoie beaucoup d’internes en médecine ayant besoin d’aides pour écrire leurs thèses. Je ne fais jamais de commentaires sur les connaissances méthodologiques des directeurs de thèses… NO COMMENT. Voici un cas rencontré plusieurs fois : Que penser du tandem directeur de thèse / interne ? J’ai […]

Améliorer l’accès aux soins en diversifiant l’activité des soignants peut se faire par le développement des infirmiers en pratique avancée (IPA). Nous avons vu avant-hier que les IPA publiaient, avec un exemple de publication dans une revue de rang A. Hier, nous avons vu que l’arrivée de nouveaux acteurs qui seraient auteurs d’articles posaient quelques […]

Nous avons vu hier la JIRSI 2023 qui s’adresse aux professionnels paramédicaux ayant des activités de recherche clinique. Parmi eux, il y a les IPA (Infirmiers de pratique avancée), profession qui doit trouver sa place dans les organisations de soins. Il y a 1600 IPA en France, et s’intégrer dans un système oblige de se […]

J’ai eu l’honneur d’être invité lors de la journée du 28 novembre 2023 du GIRCI IDF. Il y a sept groupements interrégionaux pour la recherche clinique et l’innovation (GIRCI) en France. Le GIRCI IDF (Ile de France) fédère et anime un collectif de plus de 30 établissements de santé et représentants de professionnels de santé […]

Un beau programme à découvrir C’est le mercredi 20 mars 2024 que nous sommes invités par l’Ofis pour discuter des Enjeux pour l’évaluation et le financement de la recherche biomédicale en France. Il faut s’inscrire sur le site Ofis. Gratuit, merci. Question importante au sein des établissements de santé qui ont besoin de ressources pour […]

C’est un tweet de Retraction Watch (RW) le 25 février 2024 qui nous informe sur la démission en mai 2023 de 31 rédacteurs de la revue Frontiers in Sustainability. Il arrive que des comités de rédaction, des rédacteurs soient en conflit avec l’éditeur. Sur Retraction Watch, il y a une liste de 29 cas de […]

Je n’ai pas pour habitude de relayer des demandes d’enquêtes, mais celle ci me paraît originale et utile pour comparer la France aux autres pays dans le domaine de l’IA (Intelligence Artificielle). Elle provient de la meilleure équipe de journalologie au Canada, dirigée par David Moher. Le centre de journalologie est à Ottawa et a […]

C’est une courte lettre de recherche dans JAMA surgery en décembre 2023 évaluant l’adoption de la science ouverte par les milieux académiques. Désolant car le retard est grand par rapport à certaines disciplines. Ce sont 8 journaux de chirurgie qui ont été analysés : JAMA Surgery, Annals of Surgery, British Journal of Surgery, Journal of […]

Retour en France pour continuer des recherches Vous avez passé deux ans aux Etats-Unis dans un labo prestigieux avant de revenir en France. Le directeur de l’institut de recherche supervise plusieurs départements et environ 1000 chercheurs. Vous ne l’avez jamais rencontré. Vous êtes enthousiaste au vu des résultats d’expériences récentes. Ils seront acceptés dans une […]

L’intelligence artificielle (IA) aide les auteurs et la plupart des instructions des revues acceptent que l’IA soit utilisée. Une condition : il faut préciser ce qu’a fait l’IA dans les méthodes ou des annexes, voire ajouter les prompts (requêtes). Dans le domaine des images, rien n’est consensuel car des revues refusent totalement l’utilisation de l’IA, […]

Cet article de PLOS ONE publié en février 2024 rapporte une recherche faite par deux chercheurs suisses (Genève). J’utilise parfois ces traducteurs et j’ai constaté que je diminuais (correction faite pour enlever la faute) légèrement les fautes de grammaire. En bref, les méthodes : ‘Then, in spring 2022, we selected all MTs allowing the translation […]

Situation réelle… j’ai vu la lettre !! Très nord-américain !!! Enfin mon manuscrit a été accepté par une revue prestigieuse Le manuscrit de ma recherche vient d’être accepté après plusieurs commentaires et échanges avec les relecteurs (peer-review)… cela a pris beaucoup de temps et demandé des analyses complémentaires. Le rédacteur en chef vient de m’envoyer […]